Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A4Q9H015 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC22A4Q9H015 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A4Q9H015 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A4Q9H015 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A4Q9H015 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A4Q9H015 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A4Q9H015 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A4Q9H015 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC22A4Q9H015 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC22A4Q9H015 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC22A4Q9H015 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms