Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTAP01040 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTAP01040 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTAP01040 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTAP01040 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTAP01040 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTAP01040 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTAP01040 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTAP01040 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTAP01040 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTAP01040 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTAP01040 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTAP01040 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTAP01040 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTAP01040 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTAP01040 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTAP01040 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTAP01040 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTAP01040 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTAP01040 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CSTAP01040 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CSTAP01040 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CSTAP01040 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTAP01040 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTAP01040 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTAP01040 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTAP01040 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTAP01040 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTAP01040 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTAP01040 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTAP01040 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTAP01040 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTAP01040 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTAP01040 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTAP01040 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTAP01040 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTAP01040 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTAP01040 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTAP01040 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTAP01040 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTAP01040 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTAP01040 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTAP01040 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTAP01040 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTAP01040 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTAP01040 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTAP01040 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTAP01040 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTAP01040 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTAP01040 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTAP01040 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTAP01040 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTAP01040 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTAP01040 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTAP01040 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTAP01040 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTAP01040 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTAP01040 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTAP01040 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTAP01040 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTAP01040 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTAP01040 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTAP01040 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTAP01040 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTAP01040 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTAP01040 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTAP01040 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTAP01040 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTAP01040 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTAP01040 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CSTAP01040 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTAP01040 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTAP01040 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTAP01040 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTAP01040 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTAP01040 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTAP01040 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTAP01040 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTAP01040 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTAP01040 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTAP01040 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTAP01040 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTAP01040 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTAP01040 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTAP01040 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTAP01040 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTAP01040 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTAP01040 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTAP01040 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTAP01040 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTAP01040 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTAP01040 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTAP01040 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTAP01040 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTAP01040 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTAP01040 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTAP01040 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTAP01040 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTAP01040 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTAP01040 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms