Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KIF3BO15066 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KIF3BO15066 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KIF3BO15066 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
KIF3BO15066 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
KIF3BO15066 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KIF3BO15066 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KIF3BO15066 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
KIF3BO15066 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KIF3BO15066 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KIF3BO15066 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KIF3BO15066 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
KIF3BO15066 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
KIF3BO15066 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
KIF3BO15066 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KIF3BO15066 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KIF3BO15066 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KIF3BO15066 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KIF3BO15066 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KIF3BO15066 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
KIF3BO15066 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
KIF3BO15066 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KIF3BO15066 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KIF3BO15066 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
KIF3BO15066 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
KIF3BO15066 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
KIF3BO15066 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
KIF3BO15066 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
KIF3BO15066 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
KIF3BO15066 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
KIF3BO15066 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KIF3BO15066 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KIF3BO15066 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KIF3BO15066 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
KIF3BO15066 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
KIF3BO15066 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KIF3BO15066 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
KIF3BO15066 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KIF3BO15066 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
KIF3BO15066 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
KIF3BO15066 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KIF3BO15066 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
KIF3BO15066 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KIF3BO15066 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
KIF3BO15066 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
KIF3BO15066 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms