Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms