Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK2

ATXN7L1, Ataxin-7-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L1Q9ULK2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN7L1Q9ULK2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN7L1Q9ULK2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN7L1Q9ULK2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms