RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368452.6

PKIB-205, Transcript of cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKIB, Length 1,398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKIB-205ENST00000368452 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.13■■■■■ 6.74
PKIB-205ENST00000368452 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.88■■■■■ 5.74
PKIB-205ENST00000368452 ABCC9O60706 1549 aa49.87■■■■■ 5.57
PKIB-205ENST00000368452 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.91■■■■■ 5.26
PKIB-205ENST00000368452 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.81■■■■■ 5.24
PKIB-205ENST00000368452 NACADO15069 1562 aa47.8■■■■■ 5.24
PKIB-205ENST00000368452 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.58■■■■■ 5.21
PKIB-205ENST00000368452 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.42■■■■■ 5.18
PKIB-205ENST00000368452 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.21■■■■■ 5.15
PKIB-205ENST00000368452 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.94■■■■■ 5.11
PKIB-205ENST00000368452 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.57■■■■■ 5.05
PKIB-205ENST00000368452 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.48■■■■■ 5.03
PKIB-205ENST00000368452 SCRIBQ14160 1630 aa46.47■■■■■ 5.03
PKIB-205ENST00000368452 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.89■■■■■ 4.94
PKIB-205ENST00000368452 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.8■■■■■ 4.92
PKIB-205ENST00000368452 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
PKIB-205ENST00000368452 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.12■■■■■ 4.81
PKIB-205ENST00000368452 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.78■■■■■ 4.76
PKIB-205ENST00000368452 SMARCA4P51532 1647 aa44.4■■■■■ 4.7
PKIB-205ENST00000368452 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.3■■■■■ 4.68
PKIB-205ENST00000368452 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.12■■■■■ 4.65
PKIB-205ENST00000368452 SMARCA2P51531 1590 aa44.08■■■■■ 4.65
PKIB-205ENST00000368452 NCAPD3P42695 1498 aa44.07■■■■■ 4.65
PKIB-205ENST00000368452 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.06■■■■■ 4.64
PKIB-205ENST00000368452 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.91■■■■■ 4.62
PKIB-205ENST00000368452 HMGXB3Q12766 1538 aa43.9■■■■■ 4.62
PKIB-205ENST00000368452 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.79■■■■■ 4.6
PKIB-205ENST00000368452 WIZO95785 1651 aa43.64■■■■■ 4.58
PKIB-205ENST00000368452 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
PKIB-205ENST00000368452 NESP48681 1621 aa43.14■■■■■ 4.5
PKIB-205ENST00000368452 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.11■■■■■ 4.49
PKIB-205ENST00000368452 ERCC6Q03468 1493 aa42.99■■■■■ 4.47
PKIB-205ENST00000368452 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.98■■■■■ 4.47
PKIB-205ENST00000368452 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.79■■■■■ 4.44
PKIB-205ENST00000368452 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.7■■■■■ 4.43
PKIB-205ENST00000368452 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.65■■■■■ 4.42
PKIB-205ENST00000368452 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.59■■■■■ 4.41
PKIB-205ENST00000368452 CFTRP13569 1480 aa42.54■■■■■ 4.4
PKIB-205ENST00000368452 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
PKIB-205ENST00000368452 CUX2O14529 1486 aa42.51■■■■■ 4.39
PKIB-205ENST00000368452 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
PKIB-205ENST00000368452 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.35■■■■■ 4.37
PKIB-205ENST00000368452 PRDM2Q13029 1718 aa42.35■■■■■ 4.37
PKIB-205ENST00000368452 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.31■■■■■ 4.36
PKIB-205ENST00000368452 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.26■■■■■ 4.36
PKIB-205ENST00000368452 WDR62O43379 1518 aa42.14■■■■■ 4.34
PKIB-205ENST00000368452 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
PKIB-205ENST00000368452 TOPBP1Q92547 1522 aa41.67■■■■■ 4.26
PKIB-205ENST00000368452 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.63■■■■■ 4.25
PKIB-205ENST00000368452 ABCC8Q09428 1581 aa41.6■■■■■ 4.25
PKIB-205ENST00000368452 IFT140Q96RY7 1462 aa41.4■■■■■ 4.22
PKIB-205ENST00000368452 CUX1P39880 1505 aa41.34■■■■■ 4.21
PKIB-205ENST00000368452 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
PKIB-205ENST00000368452 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
PKIB-205ENST00000368452 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.26■■■■■ 4.2
PKIB-205ENST00000368452 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
PKIB-205ENST00000368452 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.22■■■■■ 4.19
PKIB-205ENST00000368452 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.15■■■■■ 4.18
PKIB-205ENST00000368452 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
PKIB-205ENST00000368452 SOGA1O94964 1423 aa41.12■■■■■ 4.17
PKIB-205ENST00000368452 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.01■■■■■ 4.16
PKIB-205ENST00000368452 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.01■■■■■ 4.16
PKIB-205ENST00000368452 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.99■■■■■ 4.15
PKIB-205ENST00000368452 SYNJ1O43426 1573 aa40.99■■■■■ 4.15
PKIB-205ENST00000368452 TOP2BQ02880 1626 aa40.97■■■■■ 4.15
PKIB-205ENST00000368452 WDR97A6NE52 1622 aa40.93■■■■■ 4.14
PKIB-205ENST00000368452 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
PKIB-205ENST00000368452 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.77■■■■■ 4.12
PKIB-205ENST00000368452 OSCARQ8IYS5 282 aa40.71■■■■■ 4.11
PKIB-205ENST00000368452 PBRM1Q86U86 1689 aa40.68■■■■■ 4.1
PKIB-205ENST00000368452 CHD1O14646 1710 aa40.68■■■■■ 4.1
PKIB-205ENST00000368452 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.68■■■■■ 4.1
PKIB-205ENST00000368452 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.66■■■■■ 4.1
PKIB-205ENST00000368452 GRIN2BQ13224 1484 aa40.65■■■■■ 4.1
PKIB-205ENST00000368452 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.65■■■■■ 4.1
PKIB-205ENST00000368452 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
PKIB-205ENST00000368452 FBLN2P98095 1184 aa40.55■■■■■ 4.08
PKIB-205ENST00000368452 SYNJ2O15056 1496 aa40.4■■■■■ 4.06
PKIB-205ENST00000368452 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.06
PKIB-205ENST00000368452 ADAMTS12P58397 1594 aa40.29■■■■■ 4.04
PKIB-205ENST00000368452 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.29■■■■■ 4.04
PKIB-205ENST00000368452 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.18■■■■■ 4.02
PKIB-205ENST00000368452 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.18■■■■■ 4.02
PKIB-205ENST00000368452 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.18■■■■■ 4.02
PKIB-205ENST00000368452 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.16■■■■■ 4.02
PKIB-205ENST00000368452 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.15■■■■■ 4.02
PKIB-205ENST00000368452 KIF27Q86VH2 1401 aa40.15■■■■■ 4.02
PKIB-205ENST00000368452 GRIN2AQ12879 1464 aa40.14■■■■■ 4.02
PKIB-205ENST00000368452 ARHGEF11O15085 1522 aa40.12■■■■■ 4.01
PKIB-205ENST00000368452 CEP170Q5SW79 1584 aa39.99■■■■□ 3.99
PKIB-205ENST00000368452 TRIM41Q8WV44 630 aa39.98■■■■□ 3.99
PKIB-205ENST00000368452 IGF1RP08069 1367 aa39.97■■■■□ 3.99
PKIB-205ENST00000368452 CUL7Q14999 1698 aa39.96■■■■□ 3.99
PKIB-205ENST00000368452 NUP160Q12769 1436 aa39.94■■■■□ 3.98
PKIB-205ENST00000368452 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.83■■■■□ 3.97
PKIB-205ENST00000368452 ARAP1Q96P48 1450 aa39.79■■■■□ 3.96
PKIB-205ENST00000368452 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.76■■■■□ 3.96
PKIB-205ENST00000368452 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.72■■■■□ 3.95
PKIB-205ENST00000368452 SHROOM2Q13796 1616 aa39.7■■■■□ 3.95
PKIB-205ENST00000368452 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.64■■■■□ 3.94
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