RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373459.4

VSTM2L-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2 like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene VSTM2L, Length 831 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2L-201ENST00000373459 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.99■■■■■ 6.71
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VSTM2L-201ENST00000373459 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.83■■■■■ 5.25
VSTM2L-201ENST00000373459 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.77■■■■■ 5.24
VSTM2L-201ENST00000373459 NACADO15069 1562 aa47.75■■■■■ 5.23
VSTM2L-201ENST00000373459 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.41■■■■■ 5.18
VSTM2L-201ENST00000373459 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.37■■■■■ 5.17
VSTM2L-201ENST00000373459 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.11■■■■■ 5.13
VSTM2L-201ENST00000373459 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.82■■■■■ 5.09
VSTM2L-201ENST00000373459 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.63■■■■■ 5.06
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VSTM2L-201ENST00000373459 SCRIBQ14160 1630 aa46.29■■■■■ 5
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VSTM2L-201ENST00000373459 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.1■■■■■ 4.81
VSTM2L-201ENST00000373459 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.82■■■■■ 4.77
VSTM2L-201ENST00000373459 SMARCA4P51532 1647 aa44.26■■■■■ 4.68
VSTM2L-201ENST00000373459 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.15■■■■■ 4.66
VSTM2L-201ENST00000373459 NCAPD3P42695 1498 aa44.08■■■■■ 4.65
VSTM2L-201ENST00000373459 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.08■■■■■ 4.65
VSTM2L-201ENST00000373459 SMARCA2P51531 1590 aa43.98■■■■■ 4.63
VSTM2L-201ENST00000373459 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.95■■■■■ 4.63
VSTM2L-201ENST00000373459 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.82■■■■■ 4.61
VSTM2L-201ENST00000373459 HMGXB3Q12766 1538 aa43.81■■■■■ 4.6
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VSTM2L-201ENST00000373459 ERCC6Q03468 1493 aa42.96■■■■■ 4.47
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VSTM2L-201ENST00000373459 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.92■■■■■ 4.46
VSTM2L-201ENST00000373459 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.79■■■■■ 4.44
VSTM2L-201ENST00000373459 CUX2O14529 1486 aa42.68■■■■■ 4.42
VSTM2L-201ENST00000373459 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.65■■■■■ 4.42
VSTM2L-201ENST00000373459 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.58■■■■■ 4.41
VSTM2L-201ENST00000373459 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.49■■■■■ 4.39
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VSTM2L-201ENST00000373459 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
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VSTM2L-201ENST00000373459 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.24■■■■■ 4.35
VSTM2L-201ENST00000373459 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.23■■■■■ 4.35
VSTM2L-201ENST00000373459 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.23■■■■■ 4.35
VSTM2L-201ENST00000373459 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
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VSTM2L-201ENST00000373459 WDR62O43379 1518 aa42.1■■■■■ 4.33
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VSTM2L-201ENST00000373459 ABCC8Q09428 1581 aa41.55■■■■■ 4.24
VSTM2L-201ENST00000373459 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.51■■■■■ 4.24
VSTM2L-201ENST00000373459 IFT140Q96RY7 1462 aa41.36■■■■■ 4.21
VSTM2L-201ENST00000373459 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
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VSTM2L-201ENST00000373459 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.11■■■■■ 4.17
VSTM2L-201ENST00000373459 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.09■■■■■ 4.17
VSTM2L-201ENST00000373459 SOGA1O94964 1423 aa41.08■■■■■ 4.17
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VSTM2L-201ENST00000373459 OSCARQ8IYS5 282 aa40.83■■■■■ 4.13
VSTM2L-201ENST00000373459 SYNJ1O43426 1573 aa40.8■■■■■ 4.12
VSTM2L-201ENST00000373459 TOP2BQ02880 1626 aa40.8■■■■■ 4.12
VSTM2L-201ENST00000373459 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.79■■■■■ 4.12
VSTM2L-201ENST00000373459 WDR97A6NE52 1622 aa40.76■■■■■ 4.12
VSTM2L-201ENST00000373459 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.69■■■■■ 4.1
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VSTM2L-201ENST00000373459 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.59■■■■■ 4.09
VSTM2L-201ENST00000373459 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.58■■■■■ 4.09
VSTM2L-201ENST00000373459 CHD1O14646 1710 aa40.57■■■■■ 4.09
VSTM2L-201ENST00000373459 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.54■■■■■ 4.08
VSTM2L-201ENST00000373459 FBLN2P98095 1184 aa40.54■■■■■ 4.08
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VSTM2L-201ENST00000373459 PBRM1Q86U86 1689 aa40.5■■■■■ 4.07
VSTM2L-201ENST00000373459 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
VSTM2L-201ENST00000373459 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
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VSTM2L-201ENST00000373459 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.17■■■■■ 4.02
VSTM2L-201ENST00000373459 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.17■■■■■ 4.02
VSTM2L-201ENST00000373459 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.17■■■■■ 4.02
VSTM2L-201ENST00000373459 ADAMTS12P58397 1594 aa40.16■■■■■ 4.02
VSTM2L-201ENST00000373459 ARHGEF11O15085 1522 aa40.14■■■■■ 4.02
VSTM2L-201ENST00000373459 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.11■■■■■ 4.01
VSTM2L-201ENST00000373459 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.09■■■■■ 4.01
VSTM2L-201ENST00000373459 GRIN2AQ12879 1464 aa40.07■■■■■ 4.01
VSTM2L-201ENST00000373459 KIF27Q86VH2 1401 aa40.03■■■■■ 4
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VSTM2L-201ENST00000373459 NUP160Q12769 1436 aa39.91■■■■□ 3.98
VSTM2L-201ENST00000373459 CEP170Q5SW79 1584 aa39.9■■■■□ 3.98
VSTM2L-201ENST00000373459 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.84■■■■□ 3.97
VSTM2L-201ENST00000373459 ARAP1Q96P48 1450 aa39.81■■■■□ 3.96
VSTM2L-201ENST00000373459 CUL7Q14999 1698 aa39.76■■■■□ 3.96
VSTM2L-201ENST00000373459 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.69■■■■□ 3.94
VSTM2L-201ENST00000373459 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.68■■■■□ 3.94
VSTM2L-201ENST00000373459 SHROOM2Q13796 1616 aa39.62■■■■□ 3.93
VSTM2L-201ENST00000373459 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.6■■■■□ 3.93
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