RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629528.2

ERO1A-211, Transcript of endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ERO1A, Length 998 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERO1A-211ENST00000629528 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.09■■■■■ 6.73
ERO1A-211ENST00000629528 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.81■■■■■ 5.72
ERO1A-211ENST00000629528 ABCC9O60706 1549 aa49.64■■■■■ 5.54
ERO1A-211ENST00000629528 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.84■■■■■ 5.25
ERO1A-211ENST00000629528 NACADO15069 1562 aa47.81■■■■■ 5.24
ERO1A-211ENST00000629528 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.61■■■■■ 5.21
ERO1A-211ENST00000629528 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.57■■■■■ 5.21
ERO1A-211ENST00000629528 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.55■■■■■ 5.2
ERO1A-211ENST00000629528 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.35■■■■■ 5.17
ERO1A-211ENST00000629528 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.59■■■■■ 5.05
ERO1A-211ENST00000629528 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.34■■■■■ 5.01
ERO1A-211ENST00000629528 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.33■■■■■ 5.01
ERO1A-211ENST00000629528 SCRIBQ14160 1630 aa46.22■■■■■ 4.99
ERO1A-211ENST00000629528 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.21■■■■■ 4.99
ERO1A-211ENST00000629528 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.06■■■■■ 4.96
ERO1A-211ENST00000629528 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
ERO1A-211ENST00000629528 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.93■■■■■ 4.78
ERO1A-211ENST00000629528 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.67■■■■■ 4.74
ERO1A-211ENST00000629528 SMARCA4P51532 1647 aa44.28■■■■■ 4.68
ERO1A-211ENST00000629528 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.28■■■■■ 4.68
ERO1A-211ENST00000629528 NCAPD3P42695 1498 aa44.13■■■■■ 4.65
ERO1A-211ENST00000629528 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.08■■■■■ 4.65
ERO1A-211ENST00000629528 SMARCA2P51531 1590 aa44.07■■■■■ 4.65
ERO1A-211ENST00000629528 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.95■■■■■ 4.63
ERO1A-211ENST00000629528 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.93■■■■■ 4.62
ERO1A-211ENST00000629528 HMGXB3Q12766 1538 aa43.91■■■■■ 4.62
ERO1A-211ENST00000629528 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
ERO1A-211ENST00000629528 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
ERO1A-211ENST00000629528 WIZO95785 1651 aa43.41■■■■■ 4.54
ERO1A-211ENST00000629528 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
ERO1A-211ENST00000629528 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.95■■■■■ 4.47
ERO1A-211ENST00000629528 NESP48681 1621 aa42.93■■■■■ 4.46
ERO1A-211ENST00000629528 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.92■■■■■ 4.46
ERO1A-211ENST00000629528 ERCC6Q03468 1493 aa42.85■■■■■ 4.45
ERO1A-211ENST00000629528 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.8■■■■■ 4.44
ERO1A-211ENST00000629528 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.67■■■■■ 4.42
ERO1A-211ENST00000629528 CFTRP13569 1480 aa42.55■■■■■ 4.4
ERO1A-211ENST00000629528 CUX2O14529 1486 aa42.51■■■■■ 4.4
ERO1A-211ENST00000629528 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.5■■■■■ 4.39
ERO1A-211ENST00000629528 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.41■■■■■ 4.38
ERO1A-211ENST00000629528 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
ERO1A-211ENST00000629528 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.28■■■■■ 4.36
ERO1A-211ENST00000629528 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.25■■■■■ 4.35
ERO1A-211ENST00000629528 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.21■■■■■ 4.35
ERO1A-211ENST00000629528 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
ERO1A-211ENST00000629528 PRDM2Q13029 1718 aa42.14■■■■■ 4.34
ERO1A-211ENST00000629528 WDR62O43379 1518 aa42.08■■■■■ 4.33
ERO1A-211ENST00000629528 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
ERO1A-211ENST00000629528 ABCC8Q09428 1581 aa41.69■■■■■ 4.26
ERO1A-211ENST00000629528 TOPBP1Q92547 1522 aa41.59■■■■■ 4.25
ERO1A-211ENST00000629528 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.56■■■■■ 4.24
ERO1A-211ENST00000629528 IFT140Q96RY7 1462 aa41.4■■■■■ 4.22
ERO1A-211ENST00000629528 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
ERO1A-211ENST00000629528 CUX1P39880 1505 aa41.23■■■■■ 4.19
ERO1A-211ENST00000629528 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
ERO1A-211ENST00000629528 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.11■■■■■ 4.17
ERO1A-211ENST00000629528 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
ERO1A-211ENST00000629528 SOGA1O94964 1423 aa41.07■■■■■ 4.16
ERO1A-211ENST00000629528 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.99■■■■■ 4.15
ERO1A-211ENST00000629528 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.99■■■■■ 4.15
ERO1A-211ENST00000629528 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
ERO1A-211ENST00000629528 WDR97A6NE52 1622 aa40.94■■■■■ 4.14
ERO1A-211ENST00000629528 TOP2BQ02880 1626 aa40.9■■■■■ 4.14
ERO1A-211ENST00000629528 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.89■■■■■ 4.14
ERO1A-211ENST00000629528 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.87■■■■■ 4.131e-6■■■□□ 18.5
ERO1A-211ENST00000629528 SYNJ1O43426 1573 aa40.82■■■■■ 4.13
ERO1A-211ENST00000629528 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
ERO1A-211ENST00000629528 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.77■■■■■ 4.12
ERO1A-211ENST00000629528 TRIM41Q8WV44 630 aa40.72■■■■■ 4.11
ERO1A-211ENST00000629528 OSCARQ8IYS5 282 aa40.67■■■■■ 4.1
ERO1A-211ENST00000629528 GRIN2BQ13224 1484 aa40.63■■■■■ 4.09
ERO1A-211ENST00000629528 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.6■■■■■ 4.09
ERO1A-211ENST00000629528 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.58■■■■■ 4.09
ERO1A-211ENST00000629528 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
ERO1A-211ENST00000629528 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.52■■■■■ 4.08
ERO1A-211ENST00000629528 PBRM1Q86U86 1689 aa40.45■■■■■ 4.07
ERO1A-211ENST00000629528 CHD1O14646 1710 aa40.39■■■■■ 4.06
ERO1A-211ENST00000629528 SYNJ2O15056 1496 aa40.38■■■■■ 4.05
ERO1A-211ENST00000629528 FBLN2P98095 1184 aa40.35■■■■■ 4.05
ERO1A-211ENST00000629528 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
ERO1A-211ENST00000629528 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.3■■■■■ 4.04
ERO1A-211ENST00000629528 ADAMTS12P58397 1594 aa40.19■■■■■ 4.02
ERO1A-211ENST00000629528 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.16■■■■■ 4.02
ERO1A-211ENST00000629528 KIF27Q86VH2 1401 aa40.16■■■■■ 4.02
ERO1A-211ENST00000629528 GRIN2AQ12879 1464 aa40.09■■■■■ 4.01
ERO1A-211ENST00000629528 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.07■■■■■ 4.01
ERO1A-211ENST00000629528 ARHGEF11O15085 1522 aa40.01■■■■□ 3.99
ERO1A-211ENST00000629528 IGF1RP08069 1367 aa39.97■■■■□ 3.99
ERO1A-211ENST00000629528 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.96■■■■□ 3.99
ERO1A-211ENST00000629528 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.96■■■■□ 3.99
ERO1A-211ENST00000629528 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.96■■■■□ 3.99
ERO1A-211ENST00000629528 NUP160Q12769 1436 aa39.95■■■■□ 3.99
ERO1A-211ENST00000629528 CUL7Q14999 1698 aa39.89■■■■□ 3.98
ERO1A-211ENST00000629528 CEP170Q5SW79 1584 aa39.84■■■■□ 3.97
ERO1A-211ENST00000629528 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.73■■■■□ 3.95
ERO1A-211ENST00000629528 ARAP1Q96P48 1450 aa39.66■■■■□ 3.94
ERO1A-211ENST00000629528 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.64■■■■□ 3.94
ERO1A-211ENST00000629528 SHROOM2Q13796 1616 aa39.62■■■■□ 3.93
ERO1A-211ENST00000629528 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.57■■■■□ 3.93
ERO1A-211ENST00000629528 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.55■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms