RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378284.6

EBPL-205, Transcript of EBP like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene EBPL, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBPL-205ENST00000378284 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.43■■■■■ 6.78
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EBPL-205ENST00000378284 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.48■■■■■ 5.35
EBPL-205ENST00000378284 NACADO15069 1562 aa48.32■■■■■ 5.33
EBPL-205ENST00000378284 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.14■■■■■ 5.3
EBPL-205ENST00000378284 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.91■■■■■ 5.26
EBPL-205ENST00000378284 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.75■■■■■ 5.23
EBPL-205ENST00000378284 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.52■■■■■ 5.2
EBPL-205ENST00000378284 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.3■■■■■ 5.16
EBPL-205ENST00000378284 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.19■■■■■ 5.14
EBPL-205ENST00000378284 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.1■■■■■ 5.13
EBPL-205ENST00000378284 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.02■■■■■ 5.12
EBPL-205ENST00000378284 SCRIBQ14160 1630 aa46.71■■■■■ 5.07
EBPL-205ENST00000378284 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.55■■■■■ 5.04
EBPL-205ENST00000378284 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.82■■■■■ 4.93
EBPL-205ENST00000378284 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.74■■■■■ 4.91
EBPL-205ENST00000378284 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.53■■■■■ 4.88
EBPL-205ENST00000378284 SMARCA4P51532 1647 aa44.64■■■■■ 4.74
EBPL-205ENST00000378284 NCAPD3P42695 1498 aa44.6■■■■■ 4.73
EBPL-205ENST00000378284 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.55■■■■■ 4.72
EBPL-205ENST00000378284 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.54■■■■■ 4.72
EBPL-205ENST00000378284 SMARCA2P51531 1590 aa44.48■■■■■ 4.71
EBPL-205ENST00000378284 HMGXB3Q12766 1538 aa44.34■■■■■ 4.69
EBPL-205ENST00000378284 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.24■■■■■ 4.67
EBPL-205ENST00000378284 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.24■■■■■ 4.67
EBPL-205ENST00000378284 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
EBPL-205ENST00000378284 WIZO95785 1651 aa43.72■■■■■ 4.59
EBPL-205ENST00000378284 ERCC6Q03468 1493 aa43.66■■■■■ 4.58
EBPL-205ENST00000378284 NESP48681 1621 aa43.63■■■■■ 4.58
EBPL-205ENST00000378284 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.58■■■■■ 4.57
EBPL-205ENST00000378284 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.49■■■■■ 4.55
EBPL-205ENST00000378284 CUX2O14529 1486 aa43.39■■■■■ 4.54
EBPL-205ENST00000378284 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.37■■■■■ 4.53
EBPL-205ENST00000378284 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.28■■■■■ 4.52
EBPL-205ENST00000378284 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
EBPL-205ENST00000378284 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.22■■■■■ 4.51
EBPL-205ENST00000378284 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
EBPL-205ENST00000378284 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.08■■■■■ 4.49
EBPL-205ENST00000378284 CFTRP13569 1480 aa42.92■■■■■ 4.46
EBPL-205ENST00000378284 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.8■■■■■ 4.44
EBPL-205ENST00000378284 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.77■■■■■ 4.44
EBPL-205ENST00000378284 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.76■■■■■ 4.44
EBPL-205ENST00000378284 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.75■■■■■ 4.43
EBPL-205ENST00000378284 WDR62O43379 1518 aa42.67■■■■■ 4.42
EBPL-205ENST00000378284 PRDM2Q13029 1718 aa42.49■■■■■ 4.39
EBPL-205ENST00000378284 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
EBPL-205ENST00000378284 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
EBPL-205ENST00000378284 TOPBP1Q92547 1522 aa42.03■■■■■ 4.32
EBPL-205ENST00000378284 ABCC8Q09428 1581 aa42.02■■■■■ 4.32
EBPL-205ENST00000378284 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.94■■■■■ 4.3
EBPL-205ENST00000378284 IFT140Q96RY7 1462 aa41.9■■■■■ 4.3
EBPL-205ENST00000378284 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
EBPL-205ENST00000378284 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
EBPL-205ENST00000378284 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
EBPL-205ENST00000378284 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
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EBPL-205ENST00000378284 OSCARQ8IYS5 282 aa41.5■■■■■ 4.23
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EBPL-205ENST00000378284 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.47■■■■■ 4.23
EBPL-205ENST00000378284 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.46■■■■■ 4.23
EBPL-205ENST00000378284 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.43■■■■■ 4.22
EBPL-205ENST00000378284 TRIM41Q8WV44 630 aa41.34■■■■■ 4.21
EBPL-205ENST00000378284 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
EBPL-205ENST00000378284 WDR97A6NE52 1622 aa41.27■■■■■ 4.2
EBPL-205ENST00000378284 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.1■■■■■ 4.17
EBPL-205ENST00000378284 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.07■■■■■ 4.16
EBPL-205ENST00000378284 CHD1O14646 1710 aa41.07■■■■■ 4.16
EBPL-205ENST00000378284 TOP2BQ02880 1626 aa41.06■■■■■ 4.16
EBPL-205ENST00000378284 GRIN2BQ13224 1484 aa41.05■■■■■ 4.16
EBPL-205ENST00000378284 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.04■■■■■ 4.16
EBPL-205ENST00000378284 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.04■■■■■ 4.16
EBPL-205ENST00000378284 FBLN2P98095 1184 aa41.02■■■■■ 4.16
EBPL-205ENST00000378284 SYNJ1O43426 1573 aa41■■■■■ 4.15
EBPL-205ENST00000378284 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
EBPL-205ENST00000378284 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.98■■■■■ 4.15
EBPL-205ENST00000378284 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.92■■■■■ 4.14
EBPL-205ENST00000378284 PBRM1Q86U86 1689 aa40.88■■■■■ 4.13
EBPL-205ENST00000378284 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
EBPL-205ENST00000378284 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.85■■■■■ 4.13
EBPL-205ENST00000378284 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.85■■■■■ 4.13
EBPL-205ENST00000378284 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.85■■■■■ 4.13
EBPL-205ENST00000378284 SYNJ2O15056 1496 aa40.83■■■■■ 4.13
EBPL-205ENST00000378284 ARHGEF11O15085 1522 aa40.82■■■■■ 4.12
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EBPL-205ENST00000378284 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.5■■■■■ 4.07
EBPL-205ENST00000378284 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.46■■■■■ 4.07
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EBPL-205ENST00000378284 NUP160Q12769 1436 aa40.36■■■■■ 4.05
EBPL-205ENST00000378284 CEP170Q5SW79 1584 aa40.31■■■■■ 4.04
EBPL-205ENST00000378284 KIF27Q86VH2 1401 aa40.29■■■■■ 4.04
EBPL-205ENST00000378284 IGF1RP08069 1367 aa40.19■■■■■ 4.02
EBPL-205ENST00000378284 SHROOM2Q13796 1616 aa40.09■■■■■ 4.01
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EBPL-205ENST00000378284 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.04■■■■■ 4
EBPL-205ENST00000378284 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.97■■■■□ 3.99
EBPL-205ENST00000378284 JPH4Q96JJ6 628 aa39.94■■■■□ 3.98
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