Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TREX1Q9NSU2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms