Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM56Q9BRZ2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM56Q9BRZ2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM56Q9BRZ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM56Q9BRZ2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM56Q9BRZ2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM56Q9BRZ2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM56Q9BRZ2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM56Q9BRZ2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM56Q9BRZ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM56Q9BRZ2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM56Q9BRZ2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM56Q9BRZ2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM56Q9BRZ2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM56Q9BRZ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM56Q9BRZ2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM56Q9BRZ2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM56Q9BRZ2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM56Q9BRZ2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms