Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00336Q6ZUF6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms