Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH2D4BQ5SQS7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH2D4BQ5SQS7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms