Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP2P46087 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP2P46087 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP2P46087 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP2P46087 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP2P46087 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP2P46087 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP2P46087 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP2P46087 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP2P46087 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP2P46087 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP2P46087 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP2P46087 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP2P46087 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP2P46087 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP2P46087 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP2P46087 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP2P46087 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP2P46087 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP2P46087 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP2P46087 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP2P46087 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP2P46087 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP2P46087 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP2P46087 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP2P46087 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP2P46087 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP2P46087 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP2P46087 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP2P46087 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP2P46087 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP2P46087 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP2P46087 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP2P46087 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP2P46087 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NOP2P46087 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP2P46087 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP2P46087 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP2P46087 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP2P46087 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP2P46087 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP2P46087 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP2P46087 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP2P46087 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP2P46087 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP2P46087 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP2P46087 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP2P46087 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP2P46087 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP2P46087 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP2P46087 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP2P46087 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP2P46087 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP2P46087 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP2P46087 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP2P46087 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP2P46087 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP2P46087 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP2P46087 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP2P46087 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP2P46087 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP2P46087 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP2P46087 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP2P46087 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP2P46087 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP2P46087 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP2P46087 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP2P46087 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP2P46087 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOP2P46087 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NOP2P46087 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOP2P46087 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOP2P46087 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOP2P46087 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOP2P46087 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOP2P46087 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP2P46087 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP2P46087 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP2P46087 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP2P46087 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP2P46087 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP2P46087 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP2P46087 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP2P46087 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP2P46087 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP2P46087 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP2P46087 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP2P46087 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP2P46087 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP2P46087 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP2P46087 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP2P46087 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP2P46087 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP2P46087 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP2P46087 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP2P46087 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP2P46087 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP2P46087 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP2P46087 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP2P46087 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms