Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
S100A1P23297 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
S100A1P23297 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
S100A1P23297 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
S100A1P23297 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
S100A1P23297 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
S100A1P23297 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
S100A1P23297 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
S100A1P23297 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
S100A1P23297 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
S100A1P23297 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
S100A1P23297 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
S100A1P23297 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
S100A1P23297 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
S100A1P23297 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
S100A1P23297 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
S100A1P23297 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
S100A1P23297 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
S100A1P23297 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
S100A1P23297 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
S100A1P23297 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
S100A1P23297 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
S100A1P23297 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
S100A1P23297 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
S100A1P23297 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
S100A1P23297 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
S100A1P23297 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
S100A1P23297 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
S100A1P23297 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
S100A1P23297 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
S100A1P23297 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
S100A1P23297 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
S100A1P23297 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
S100A1P23297 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
S100A1P23297 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
S100A1P23297 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
S100A1P23297 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
S100A1P23297 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
S100A1P23297 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
S100A1P23297 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
S100A1P23297 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
S100A1P23297 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
S100A1P23297 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
S100A1P23297 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
S100A1P23297 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
S100A1P23297 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
S100A1P23297 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
S100A1P23297 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
S100A1P23297 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
S100A1P23297 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
S100A1P23297 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
S100A1P23297 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
S100A1P23297 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
S100A1P23297 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
S100A1P23297 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
S100A1P23297 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
S100A1P23297 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
S100A1P23297 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
S100A1P23297 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
S100A1P23297 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
S100A1P23297 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
S100A1P23297 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
S100A1P23297 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
S100A1P23297 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
S100A1P23297 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
S100A1P23297 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
S100A1P23297 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
S100A1P23297 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
S100A1P23297 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
S100A1P23297 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
S100A1P23297 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
S100A1P23297 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
S100A1P23297 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
S100A1P23297 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
S100A1P23297 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
S100A1P23297 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
S100A1P23297 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
S100A1P23297 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
S100A1P23297 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
S100A1P23297 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
S100A1P23297 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
S100A1P23297 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
S100A1P23297 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
S100A1P23297 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
S100A1P23297 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
S100A1P23297 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
S100A1P23297 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
S100A1P23297 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
S100A1P23297 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
S100A1P23297 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
S100A1P23297 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
S100A1P23297 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
S100A1P23297 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
S100A1P23297 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
S100A1P23297 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
S100A1P23297 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
S100A1P23297 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
S100A1P23297 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
S100A1P23297 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
S100A1P23297 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms