RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367396.7

DENND1B-204, Transcript of DENN domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene DENND1B, Length 2,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1B-204ENST00000367396 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.52■■■■■ 5.68
DENND1B-204ENST00000367396 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.9■■■■■ 4.62
DENND1B-204ENST00000367396 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
DENND1B-204ENST00000367396 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.76■■■■■ 4.28
DENND1B-204ENST00000367396 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.7■■■■■ 4.27
DENND1B-204ENST00000367396 ABCC9O60706 1549 aa41.49■■■■■ 4.23
DENND1B-204ENST00000367396 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.45■■■■■ 4.23
DENND1B-204ENST00000367396 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.12■■■■■ 4.17
DENND1B-204ENST00000367396 NACADO15069 1562 aa40.86■■■■■ 4.13
DENND1B-204ENST00000367396 SCRIBQ14160 1630 aa40.51■■■■■ 4.08
DENND1B-204ENST00000367396 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.48■■■■■ 4.07
DENND1B-204ENST00000367396 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
DENND1B-204ENST00000367396 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.75■■■■□ 3.95
DENND1B-204ENST00000367396 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.33■■■■□ 3.89
DENND1B-204ENST00000367396 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.31■■■■□ 3.88
DENND1B-204ENST00000367396 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.29■■■■□ 3.88
DENND1B-204ENST00000367396 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.21■■■■□ 3.87
DENND1B-204ENST00000367396 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.08■■■■□ 3.85
DENND1B-204ENST00000367396 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
DENND1B-204ENST00000367396 SMARCA4P51532 1647 aa38.8■■■■□ 3.8
DENND1B-204ENST00000367396 WIZO95785 1651 aa38.78■■■■□ 3.8
DENND1B-204ENST00000367396 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.32■■■■□ 3.72
DENND1B-204ENST00000367396 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.31■■■■□ 3.72
DENND1B-204ENST00000367396 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.29■■■■□ 3.72
DENND1B-204ENST00000367396 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.13■■■■□ 3.69
DENND1B-204ENST00000367396 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
DENND1B-204ENST00000367396 SMARCA2P51531 1590 aa38.06■■■■□ 3.68
DENND1B-204ENST00000367396 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.98■■■■□ 3.67
DENND1B-204ENST00000367396 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
DENND1B-204ENST00000367396 NCAPD3P42695 1498 aa37.74■■■■□ 3.63
DENND1B-204ENST00000367396 HMGXB3Q12766 1538 aa37.68■■■■□ 3.62
DENND1B-204ENST00000367396 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.52■■■■□ 3.6
DENND1B-204ENST00000367396 TRIM41Q8WV44 630 aa37.49■■■■□ 3.59
DENND1B-204ENST00000367396 ABCC8Q09428 1581 aa37.27■■■■□ 3.56
DENND1B-204ENST00000367396 CFTRP13569 1480 aa36.97■■■■□ 3.51
DENND1B-204ENST00000367396 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.96■■■■□ 3.51
DENND1B-204ENST00000367396 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.91■■■■□ 3.5
DENND1B-204ENST00000367396 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
DENND1B-204ENST00000367396 SYNJ1O43426 1573 aa36.83■■■■□ 3.49
DENND1B-204ENST00000367396 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.81■■■■□ 3.48
DENND1B-204ENST00000367396 PRDM2Q13029 1718 aa36.76■■■■□ 3.47
DENND1B-204ENST00000367396 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.66■■■■□ 3.46
DENND1B-204ENST00000367396 TOP2BQ02880 1626 aa36.62■■■■□ 3.45
DENND1B-204ENST00000367396 SOGA1O94964 1423 aa36.61■■■■□ 3.45
DENND1B-204ENST00000367396 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.57■■■■□ 3.44
DENND1B-204ENST00000367396 CUX1P39880 1505 aa36.52■■■■□ 3.44
DENND1B-204ENST00000367396 NESP48681 1621 aa36.5■■■■□ 3.43
DENND1B-204ENST00000367396 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.49■■■■□ 3.43
DENND1B-204ENST00000367396 EEA1Q15075 1411 aa36.45■■■■□ 3.43
DENND1B-204ENST00000367396 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.42■■■■□ 3.42
DENND1B-204ENST00000367396 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.41■■■■□ 3.42
DENND1B-204ENST00000367396 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.41■■■■□ 3.42
DENND1B-204ENST00000367396 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.31■■■■□ 3.4
DENND1B-204ENST00000367396 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.14■■■■□ 3.38
DENND1B-204ENST00000367396 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.13■■■■□ 3.37
DENND1B-204ENST00000367396 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.09■■■■□ 3.37
DENND1B-204ENST00000367396 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.08■■■■□ 3.37
DENND1B-204ENST00000367396 TOPBP1Q92547 1522 aa36.04■■■■□ 3.36
DENND1B-204ENST00000367396 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.02■■■■□ 3.36
DENND1B-204ENST00000367396 KIF21BO75037 1637 aa36.01■■■■□ 3.36
DENND1B-204ENST00000367396 GOLGA3Q08378 1498 aa36■■■■□ 3.35
DENND1B-204ENST00000367396 KIF27Q86VH2 1401 aa35.98■■■■□ 3.35
DENND1B-204ENST00000367396 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
DENND1B-204ENST00000367396 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.93■■■■□ 3.34
DENND1B-204ENST00000367396 CUX2O14529 1486 aa35.89■■■■□ 3.34
DENND1B-204ENST00000367396 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
DENND1B-204ENST00000367396 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
DENND1B-204ENST00000367396 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.84■■■■□ 3.33
DENND1B-204ENST00000367396 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.82■■■■□ 3.32
DENND1B-204ENST00000367396 PRXQ9BXM0 1461 aa35.81■■■■□ 3.32
DENND1B-204ENST00000367396 CEP162Q5TB80 1403 aa35.79■■■■□ 3.32
DENND1B-204ENST00000367396 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.74■■■■□ 3.31
DENND1B-204ENST00000367396 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.72■■■■□ 3.31
DENND1B-204ENST00000367396 IGF1RP08069 1367 aa35.69■■■■□ 3.3
DENND1B-204ENST00000367396 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.67■■■■□ 3.3
DENND1B-204ENST00000367396 WDR97A6NE52 1622 aa35.61■■■■□ 3.29
DENND1B-204ENST00000367396 ERCC6Q03468 1493 aa35.51■■■■□ 3.27
DENND1B-204ENST00000367396 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.5■■■■□ 3.27
DENND1B-204ENST00000367396 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
DENND1B-204ENST00000367396 WDR62O43379 1518 aa35.48■■■■□ 3.27
DENND1B-204ENST00000367396 CLIP1P30622 1438 aa35.46■■■■□ 3.27
DENND1B-204ENST00000367396 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.45■■■■□ 3.27
DENND1B-204ENST00000367396 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.26
DENND1B-204ENST00000367396 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.37■■■■□ 3.25
DENND1B-204ENST00000367396 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.36■■■■□ 3.25
DENND1B-204ENST00000367396 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
DENND1B-204ENST00000367396 CUL7Q14999 1698 aa35.34■■■■□ 3.25
DENND1B-204ENST00000367396 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
DENND1B-204ENST00000367396 HRCP23327 699 aa35.28■■■■□ 3.24
DENND1B-204ENST00000367396 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
DENND1B-204ENST00000367396 IFT140Q96RY7 1462 aa35.25■■■■□ 3.23
DENND1B-204ENST00000367396 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.22
DENND1B-204ENST00000367396 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.19■■■■□ 3.22
DENND1B-204ENST00000367396 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.16■■■■□ 3.22
DENND1B-204ENST00000367396 PBRM1Q86U86 1689 aa35.15■■■■□ 3.22
DENND1B-204ENST00000367396 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
DENND1B-204ENST00000367396 ARAP1Q96P48 1450 aa35.11■■■■□ 3.21
DENND1B-204ENST00000367396 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.07■■■■□ 3.2
DENND1B-204ENST00000367396 GRIN2BQ13224 1484 aa35.04■■■■□ 3.2
DENND1B-204ENST00000367396 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.99■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms