Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNOT11Q9UKZ1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT11Q9UKZ1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms