Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALN1Q9BXU9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALN1Q9BXU9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALN1Q9BXU9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALN1Q9BXU9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CALN1Q9BXU9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALN1Q9BXU9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms