Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SELENOMQ8WWX9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELENOMQ8WWX9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms