Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LINC00301Q8NCQ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms