Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J9

TSEN54, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN54Q7Z6J9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSEN54Q7Z6J9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSEN54Q7Z6J9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSEN54Q7Z6J9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSEN54Q7Z6J9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSEN54Q7Z6J9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSEN54Q7Z6J9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSEN54Q7Z6J9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSEN54Q7Z6J9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSEN54Q7Z6J9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSEN54Q7Z6J9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSEN54Q7Z6J9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSEN54Q7Z6J9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSEN54Q7Z6J9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSEN54Q7Z6J9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms