Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1EQ15878 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1EQ15878 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1EQ15878 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms