Protein–RNA interactions for Protein: P98179

RBM3, RNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3P98179 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBM3P98179 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBM3P98179 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBM3P98179 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBM3P98179 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBM3P98179 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBM3P98179 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBM3P98179 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBM3P98179 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBM3P98179 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBM3P98179 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBM3P98179 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBM3P98179 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBM3P98179 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBM3P98179 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBM3P98179 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBM3P98179 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBM3P98179 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBM3P98179 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBM3P98179 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBM3P98179 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBM3P98179 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBM3P98179 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBM3P98179 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBM3P98179 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBM3P98179 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBM3P98179 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBM3P98179 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBM3P98179 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBM3P98179 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBM3P98179 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBM3P98179 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBM3P98179 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBM3P98179 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBM3P98179 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBM3P98179 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBM3P98179 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBM3P98179 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBM3P98179 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBM3P98179 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBM3P98179 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBM3P98179 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBM3P98179 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBM3P98179 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RBM3P98179 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBM3P98179 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBM3P98179 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBM3P98179 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBM3P98179 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBM3P98179 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBM3P98179 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBM3P98179 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBM3P98179 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBM3P98179 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBM3P98179 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBM3P98179 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBM3P98179 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBM3P98179 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBM3P98179 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBM3P98179 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBM3P98179 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBM3P98179 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBM3P98179 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RBM3P98179 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBM3P98179 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBM3P98179 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RBM3P98179 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBM3P98179 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBM3P98179 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBM3P98179 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBM3P98179 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBM3P98179 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBM3P98179 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBM3P98179 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBM3P98179 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBM3P98179 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBM3P98179 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBM3P98179 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBM3P98179 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBM3P98179 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBM3P98179 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBM3P98179 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBM3P98179 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RBM3P98179 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBM3P98179 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBM3P98179 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBM3P98179 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBM3P98179 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBM3P98179 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBM3P98179 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBM3P98179 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBM3P98179 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBM3P98179 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBM3P98179 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBM3P98179 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBM3P98179 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBM3P98179 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBM3P98179 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBM3P98179 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBM3P98179 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms