Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNFP41002 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNFP41002 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNFP41002 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNFP41002 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNFP41002 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNFP41002 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNFP41002 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNFP41002 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNFP41002 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNFP41002 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNFP41002 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNFP41002 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNFP41002 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNFP41002 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNFP41002 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNFP41002 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNFP41002 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNFP41002 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNFP41002 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNFP41002 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNFP41002 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNFP41002 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNFP41002 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNFP41002 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNFP41002 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNFP41002 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNFP41002 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNFP41002 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNFP41002 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNFP41002 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNFP41002 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNFP41002 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNFP41002 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNFP41002 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNFP41002 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNFP41002 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNFP41002 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNFP41002 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNFP41002 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNFP41002 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNFP41002 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNFP41002 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNFP41002 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNFP41002 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNFP41002 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNFP41002 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNFP41002 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNFP41002 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNFP41002 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNFP41002 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNFP41002 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNFP41002 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNFP41002 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNFP41002 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNFP41002 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNFP41002 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNFP41002 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNFP41002 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNFP41002 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNFP41002 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNFP41002 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNFP41002 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNFP41002 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNFP41002 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNFP41002 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNFP41002 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNFP41002 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNFP41002 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNFP41002 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNFP41002 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNFP41002 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNFP41002 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNFP41002 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNFP41002 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNFP41002 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNFP41002 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNFP41002 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNFP41002 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNFP41002 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNFP41002 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNFP41002 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNFP41002 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNFP41002 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNFP41002 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNFP41002 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNFP41002 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNFP41002 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNFP41002 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNFP41002 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNFP41002 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNFP41002 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNFP41002 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNFP41002 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNFP41002 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNFP41002 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNFP41002 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNFP41002 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNFP41002 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNFP41002 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms