Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HOXD8P13378 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXD8P13378 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD8P13378 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HOXD8P13378 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms