RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627746.2

PPP4C-214, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PPP4C, Length 1,301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-214ENST00000627746 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.82■■■■■ 6.85
PPP4C-214ENST00000627746 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.51■■■■■ 5.84
PPP4C-214ENST00000627746 ABCC9O60706 1549 aa51.18■■■■■ 5.78
PPP4C-214ENST00000627746 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.81■■■■■ 5.4
PPP4C-214ENST00000627746 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.81■■■■■ 5.4
PPP4C-214ENST00000627746 NACADO15069 1562 aa48.61■■■■■ 5.37
PPP4C-214ENST00000627746 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.05■■■■■ 5.28
PPP4C-214ENST00000627746 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.01■■■■■ 5.28
PPP4C-214ENST00000627746 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.83■■■■■ 5.25
PPP4C-214ENST00000627746 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.79■■■■■ 5.24
PPP4C-214ENST00000627746 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.68■■■■■ 5.22
PPP4C-214ENST00000627746 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.59■■■■■ 5.21
PPP4C-214ENST00000627746 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.45■■■■■ 5.19
PPP4C-214ENST00000627746 SCRIBQ14160 1630 aa47.15■■■■■ 5.14
PPP4C-214ENST00000627746 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.64■■■■■ 5.06
PPP4C-214ENST00000627746 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.21■■■■■ 4.99
PPP4C-214ENST00000627746 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.19■■■■■ 4.98
PPP4C-214ENST00000627746 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.97■■■■■ 4.95
PPP4C-214ENST00000627746 SMARCA4P51532 1647 aa44.97■■■■■ 4.79
PPP4C-214ENST00000627746 NCAPD3P42695 1498 aa44.9■■■■■ 4.78
PPP4C-214ENST00000627746 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.89■■■■■ 4.78
PPP4C-214ENST00000627746 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.8■■■■■ 4.76
PPP4C-214ENST00000627746 SMARCA2P51531 1590 aa44.72■■■■■ 4.75
PPP4C-214ENST00000627746 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.63■■■■■ 4.73
PPP4C-214ENST00000627746 HMGXB3Q12766 1538 aa44.56■■■■■ 4.72
PPP4C-214ENST00000627746 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
PPP4C-214ENST00000627746 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.46■■■■■ 4.71
PPP4C-214ENST00000627746 NESP48681 1621 aa44.15■■■■■ 4.66
PPP4C-214ENST00000627746 WIZO95785 1651 aa44.13■■■■■ 4.66
PPP4C-214ENST00000627746 ERCC6Q03468 1493 aa44.08■■■■■ 4.65
PPP4C-214ENST00000627746 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.9■■■■■ 4.62
PPP4C-214ENST00000627746 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.76■■■■■ 4.6
PPP4C-214ENST00000627746 CUX2O14529 1486 aa43.7■■■■■ 4.59
PPP4C-214ENST00000627746 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.61■■■■■ 4.57
PPP4C-214ENST00000627746 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.53■■■■■ 4.56
PPP4C-214ENST00000627746 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.52■■■■■ 4.56
PPP4C-214ENST00000627746 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.52■■■■■ 4.56
PPP4C-214ENST00000627746 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
PPP4C-214ENST00000627746 CFTRP13569 1480 aa43.2■■■■■ 4.51
PPP4C-214ENST00000627746 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.17■■■■■ 4.5
PPP4C-214ENST00000627746 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.13■■■■■ 4.49
PPP4C-214ENST00000627746 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.12■■■■■ 4.49
PPP4C-214ENST00000627746 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.11■■■■■ 4.49
PPP4C-214ENST00000627746 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.08■■■■■ 4.49
PPP4C-214ENST00000627746 WDR62O43379 1518 aa42.98■■■■■ 4.47
PPP4C-214ENST00000627746 PRDM2Q13029 1718 aa42.76■■■■■ 4.44
PPP4C-214ENST00000627746 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
PPP4C-214ENST00000627746 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
PPP4C-214ENST00000627746 TOPBP1Q92547 1522 aa42.37■■■■■ 4.37
PPP4C-214ENST00000627746 ABCC8Q09428 1581 aa42.22■■■■■ 4.35
PPP4C-214ENST00000627746 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.21■■■■■ 4.35
PPP4C-214ENST00000627746 IFT140Q96RY7 1462 aa42.18■■■■■ 4.34
PPP4C-214ENST00000627746 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
PPP4C-214ENST00000627746 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
PPP4C-214ENST00000627746 OSCARQ8IYS5 282 aa41.95■■■■■ 4.31
PPP4C-214ENST00000627746 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
PPP4C-214ENST00000627746 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.9■■■■■ 4.3
PPP4C-214ENST00000627746 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
PPP4C-214ENST00000627746 CUX1P39880 1505 aa41.88■■■■■ 4.29
PPP4C-214ENST00000627746 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.87■■■■■ 4.296e-7■■■■□ 24.5
PPP4C-214ENST00000627746 SOGA1O94964 1423 aa41.83■■■■■ 4.29
PPP4C-214ENST00000627746 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.81■■■■■ 4.28
PPP4C-214ENST00000627746 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
PPP4C-214ENST00000627746 TRIM41Q8WV44 630 aa41.63■■■■■ 4.25
PPP4C-214ENST00000627746 FBLN2P98095 1184 aa41.55■■■■■ 4.24
PPP4C-214ENST00000627746 CHD1O14646 1710 aa41.49■■■■■ 4.23
PPP4C-214ENST00000627746 WDR97A6NE52 1622 aa41.41■■■■■ 4.22
PPP4C-214ENST00000627746 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.41■■■■■ 4.22
PPP4C-214ENST00000627746 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.38■■■■■ 4.21
PPP4C-214ENST00000627746 SYNJ1O43426 1573 aa41.34■■■■■ 4.21
PPP4C-214ENST00000627746 GRIN2BQ13224 1484 aa41.33■■■■■ 4.21
PPP4C-214ENST00000627746 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.31■■■■■ 4.2
PPP4C-214ENST00000627746 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.3■■■■■ 4.2
PPP4C-214ENST00000627746 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.3■■■■■ 4.2
PPP4C-214ENST00000627746 TOP2BQ02880 1626 aa41.3■■■■■ 4.2
PPP4C-214ENST00000627746 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.3■■■■■ 4.2
PPP4C-214ENST00000627746 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.3■■■■■ 4.2
PPP4C-214ENST00000627746 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.28■■■■■ 4.2
PPP4C-214ENST00000627746 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
PPP4C-214ENST00000627746 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
PPP4C-214ENST00000627746 PBRM1Q86U86 1689 aa41.22■■■■■ 4.19
PPP4C-214ENST00000627746 ARHGEF11O15085 1522 aa41.22■■■■■ 4.19
PPP4C-214ENST00000627746 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.19■■■■■ 4.18
PPP4C-214ENST00000627746 SYNJ2O15056 1496 aa41.12■■■■■ 4.17
PPP4C-214ENST00000627746 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.01■■■■■ 4.16
PPP4C-214ENST00000627746 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.97■■■■■ 4.15
PPP4C-214ENST00000627746 ARAP1Q96P48 1450 aa40.87■■■■■ 4.13
PPP4C-214ENST00000627746 ADAMTS12P58397 1594 aa40.84■■■■■ 4.13
PPP4C-214ENST00000627746 GRIN2AQ12879 1464 aa40.81■■■■■ 4.12
PPP4C-214ENST00000627746 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.77■■■■■ 4.12
PPP4C-214ENST00000627746 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.77■■■■■ 4.12
PPP4C-214ENST00000627746 CEP170Q5SW79 1584 aa40.67■■■■■ 4.1
PPP4C-214ENST00000627746 NUP160Q12769 1436 aa40.64■■■■■ 4.1
PPP4C-214ENST00000627746 KIF27Q86VH2 1401 aa40.53■■■■■ 4.08
PPP4C-214ENST00000627746 IGF1RP08069 1367 aa40.51■■■■■ 4.08
PPP4C-214ENST00000627746 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.51■■■■■ 4.07
PPP4C-214ENST00000627746 SHROOM2Q13796 1616 aa40.37■■■■■ 4.05
PPP4C-214ENST00000627746 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
PPP4C-214ENST00000627746 JPH4Q96JJ6 628 aa40.33■■■■■ 4.05
PPP4C-214ENST00000627746 CUL7Q14999 1698 aa40.28■■■■■ 4.04
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