Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
LRRD1A4D1F6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRD1A4D1F6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms