Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
U3KQE9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
U3KQE9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U3KQE9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U3KQE9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U3KQE9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U3KQE9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U3KQE9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
U3KQE9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U3KQE9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U3KQE9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U3KQE9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U3KQE9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
U3KQE9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U3KQE9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
U3KQE9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
U3KQE9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
U3KQE9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
U3KQE9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
U3KQE9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U3KQE9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U3KQE9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U3KQE9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
U3KQE9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U3KQE9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U3KQE9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
U3KQE9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
U3KQE9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
U3KQE9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
U3KQE9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U3KQE9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U3KQE9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U3KQE9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U3KQE9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U3KQE9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
U3KQE9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
U3KQE9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U3KQE9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U3KQE9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U3KQE9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U3KQE9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U3KQE9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U3KQE9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U3KQE9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
U3KQE9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
U3KQE9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
U3KQE9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
U3KQE9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U3KQE9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
U3KQE9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U3KQE9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
U3KQE9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U3KQE9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U3KQE9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U3KQE9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U3KQE9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
U3KQE9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
U3KQE9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
U3KQE9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
U3KQE9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U3KQE9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
U3KQE9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U3KQE9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
U3KQE9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
U3KQE9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
U3KQE9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
U3KQE9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
U3KQE9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
U3KQE9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
U3KQE9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U3KQE9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U3KQE9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U3KQE9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U3KQE9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U3KQE9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
U3KQE9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
U3KQE9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U3KQE9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
U3KQE9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U3KQE9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
U3KQE9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
U3KQE9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
U3KQE9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
U3KQE9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U3KQE9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U3KQE9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
U3KQE9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
U3KQE9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
U3KQE9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
U3KQE9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
U3KQE9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U3KQE9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
U3KQE9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U3KQE9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
U3KQE9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
U3KQE9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
U3KQE9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
U3KQE9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
U3KQE9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
U3KQE9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms