Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y657

SPIN1, Spindlin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN1Q9Y657 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIN1Q9Y657 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIN1Q9Y657 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIN1Q9Y657 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIN1Q9Y657 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN1Q9Y657 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN1Q9Y657 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN1Q9Y657 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN1Q9Y657 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN1Q9Y657 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN1Q9Y657 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN1Q9Y657 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN1Q9Y657 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN1Q9Y657 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIN1Q9Y657 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIN1Q9Y657 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIN1Q9Y657 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPIN1Q9Y657 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN1Q9Y657 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms