Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMC2Q9NRP2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMC2Q9NRP2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms