Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BATF3Q9NR55 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BATF3Q9NR55 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms