RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521452.1

TMEM200B-202, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-202ENST00000521452 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.62■■■■■ 4.57
TMEM200B-202ENST00000521452 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.71■■■■□ 3.63
TMEM200B-202ENST00000521452 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
TMEM200B-202ENST00000521452 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.74■■■■□ 3.47
TMEM200B-202ENST00000521452 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.37■■■■□ 3.41
TMEM200B-202ENST00000521452 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.21■■■■□ 3.39
TMEM200B-202ENST00000521452 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.16■■■■□ 3.38
TMEM200B-202ENST00000521452 HRCP23327 699 aa35.7■■■■□ 3.3
TMEM200B-202ENST00000521452 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.66■■■■□ 3.3
TMEM200B-202ENST00000521452 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.54■■■■□ 3.28
TMEM200B-202ENST00000521452 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.26■■■■□ 3.24
TMEM200B-202ENST00000521452 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCC9O60706 1549 aa34.91■■■■□ 3.18
TMEM200B-202ENST00000521452 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
TMEM200B-202ENST00000521452 SCRIBQ14160 1630 aa34.72■■■■□ 3.15
TMEM200B-202ENST00000521452 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
TMEM200B-202ENST00000521452 TRIM41Q8WV44 630 aa34.51■■■■□ 3.11
TMEM200B-202ENST00000521452 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.4■■■■□ 3.1
TMEM200B-202ENST00000521452 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
TMEM200B-202ENST00000521452 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.14■■■■□ 3.06
TMEM200B-202ENST00000521452 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.12■■■■□ 3.05
TMEM200B-202ENST00000521452 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.99■■■■□ 3.03
TMEM200B-202ENST00000521452 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
TMEM200B-202ENST00000521452 NACADO15069 1562 aa33.97■■■■□ 3.03
TMEM200B-202ENST00000521452 WIZO95785 1651 aa33.81■■■■□ 3
TMEM200B-202ENST00000521452 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
TMEM200B-202ENST00000521452 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
TMEM200B-202ENST00000521452 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCC8Q09428 1581 aa33.25■■■□□ 2.91
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.22■■■□□ 2.91
TMEM200B-202ENST00000521452 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP33.22■■■□□ 2.91
TMEM200B-202ENST00000521452 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.2■■■□□ 2.91
TMEM200B-202ENST00000521452 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
TMEM200B-202ENST00000521452 SMARCA4P51532 1647 aa33.12■■■□□ 2.89
TMEM200B-202ENST00000521452 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.11■■■□□ 2.89
TMEM200B-202ENST00000521452 SMARCA2P51531 1590 aa33.07■■■□□ 2.88
TMEM200B-202ENST00000521452 SOGA1O94964 1423 aa33.04■■■□□ 2.88
TMEM200B-202ENST00000521452 CEP162Q5TB80 1403 aa33.01■■■□□ 2.88
TMEM200B-202ENST00000521452 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.99■■■□□ 2.87
TMEM200B-202ENST00000521452 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.89■■■□□ 2.86
TMEM200B-202ENST00000521452 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.88■■■□□ 2.85
TMEM200B-202ENST00000521452 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.87■■■□□ 2.85
TMEM200B-202ENST00000521452 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.87■■■□□ 2.85
TMEM200B-202ENST00000521452 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
TMEM200B-202ENST00000521452 EEA1Q15075 1411 aa32.76■■■□□ 2.83
TMEM200B-202ENST00000521452 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
TMEM200B-202ENST00000521452 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.74■■■□□ 2.83
TMEM200B-202ENST00000521452 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
TMEM200B-202ENST00000521452 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
TMEM200B-202ENST00000521452 NEUROD1Q13562 356 aa32.67■■■□□ 2.82
TMEM200B-202ENST00000521452 GOLGA3Q08378 1498 aa32.62■■■□□ 2.81
TMEM200B-202ENST00000521452 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.5■■■□□ 2.79
TMEM200B-202ENST00000521452 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
TMEM200B-202ENST00000521452 SYNJ1O43426 1573 aa32.41■■■□□ 2.78
TMEM200B-202ENST00000521452 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.4■■■□□ 2.78
TMEM200B-202ENST00000521452 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.39■■■□□ 2.78
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
TMEM200B-202ENST00000521452 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa32.37■■■□□ 2.77
TMEM200B-202ENST00000521452 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
TMEM200B-202ENST00000521452 CLIP1P30622 1438 aa32.33■■■□□ 2.77
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF21BO75037 1637 aa32.28■■■□□ 2.76
TMEM200B-202ENST00000521452 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.24■■■□□ 2.75
TMEM200B-202ENST00000521452 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
TMEM200B-202ENST00000521452 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.2■■■□□ 2.74
TMEM200B-202ENST00000521452 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.19■■■□□ 2.74
TMEM200B-202ENST00000521452 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
TMEM200B-202ENST00000521452 APLP2Q06481 763 aa32.15■■■□□ 2.74
TMEM200B-202ENST00000521452 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
TMEM200B-202ENST00000521452 MIER1Q8N108 512 aa32.02■■■□□ 2.72
TMEM200B-202ENST00000521452 TOP2BQ02880 1626 aa31.92■■■□□ 2.7
TMEM200B-202ENST00000521452 PRXQ9BXM0 1461 aa31.76■■■□□ 2.68
TMEM200B-202ENST00000521452 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
TMEM200B-202ENST00000521452 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.74■■■□□ 2.67
TMEM200B-202ENST00000521452 ARAP1Q96P48 1450 aa31.73■■■□□ 2.67
TMEM200B-202ENST00000521452 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.71■■■□□ 2.67
TMEM200B-202ENST00000521452 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
TMEM200B-202ENST00000521452 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.62■■■□□ 2.65
TMEM200B-202ENST00000521452 CUX1P39880 1505 aa31.6■■■□□ 2.65
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF27Q86VH2 1401 aa31.55■■■□□ 2.64
TMEM200B-202ENST00000521452 NCAPD3P42695 1498 aa31.51■■■□□ 2.63
TMEM200B-202ENST00000521452 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
TMEM200B-202ENST00000521452 HMGXB3Q12766 1538 aa31.46■■■□□ 2.63
TMEM200B-202ENST00000521452 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.41■■■□□ 2.62
TMEM200B-202ENST00000521452 ITGAEP38570 1179 aa31.41■■■□□ 2.62
TMEM200B-202ENST00000521452 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.39■■■□□ 2.62
TMEM200B-202ENST00000521452 CFTRP13569 1480 aa31.39■■■□□ 2.62
TMEM200B-202ENST00000521452 CUX2O14529 1486 aa31.3■■■□□ 2.6
TMEM200B-202ENST00000521452 IGF1RP08069 1367 aa31.23■■■□□ 2.59
TMEM200B-202ENST00000521452 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.18■■■□□ 2.58
TMEM200B-202ENST00000521452 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.09■■■□□ 2.57
TMEM200B-202ENST00000521452 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
TMEM200B-202ENST00000521452 TIAM1Q13009 1591 aa31.07■■■□□ 2.57
TMEM200B-202ENST00000521452 MAPKBP1O60336 1514 aa31.06■■■□□ 2.56
TMEM200B-202ENST00000521452 MYT1Q01538 1121 aa31.05■■■□□ 2.56
TMEM200B-202ENST00000521452 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.02■■■□□ 2.56
TMEM200B-202ENST00000521452 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.01■■■□□ 2.55
TMEM200B-202ENST00000521452 CADPSQ9ULU8 1353 aa31■■■□□ 2.55
TMEM200B-202ENST00000521452 KCNH8Q96L42 1107 aa31■■■□□ 2.55
TMEM200B-202ENST00000521452 SETD5Q9C0A6 1442 aa31■■■□□ 2.55
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