RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.63■■■■■ 5.05
MESP1-201ENST00000300057 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.19■■■■■ 4.02
MESP1-201ENST00000300057 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
MESP1-201ENST00000300057 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.92■■■■□ 3.82
MESP1-201ENST00000300057 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.66■■■■□ 3.78
MESP1-201ENST00000300057 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.37■■■■□ 3.73
MESP1-201ENST00000300057 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.64
MESP1-201ENST00000300057 ABCC9O60706 1549 aa37.72■■■■□ 3.63
MESP1-201ENST00000300057 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.59■■■■□ 3.61
MESP1-201ENST00000300057 SCRIBQ14160 1630 aa37.36■■■■□ 3.57
MESP1-201ENST00000300057 NACADO15069 1562 aa37.29■■■■□ 3.56
MESP1-201ENST00000300057 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.87■■■■□ 3.49
MESP1-201ENST00000300057 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.43
MESP1-201ENST00000300057 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.36■■■■□ 3.41
MESP1-201ENST00000300057 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.33■■■■□ 3.41
MESP1-201ENST00000300057 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.26■■■■□ 3.4
MESP1-201ENST00000300057 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.15■■■■□ 3.38
MESP1-201ENST00000300057 WIZO95785 1651 aa35.94■■■■□ 3.34
MESP1-201ENST00000300057 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
MESP1-201ENST00000300057 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.82■■■■□ 3.32
MESP1-201ENST00000300057 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.8■■■■□ 3.32
MESP1-201ENST00000300057 SMARCA4P51532 1647 aa35.72■■■■□ 3.31
MESP1-201ENST00000300057 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
MESP1-201ENST00000300057 TRIM41Q8WV44 630 aa35.31■■■■□ 3.24
MESP1-201ENST00000300057 SMARCA2P51531 1590 aa35.18■■■■□ 3.22
MESP1-201ENST00000300057 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.18■■■■□ 3.22
MESP1-201ENST00000300057 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.16■■■■□ 3.22
MESP1-201ENST00000300057 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
MESP1-201ENST00000300057 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.11■■■■□ 3.21
MESP1-201ENST00000300057 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.96■■■■□ 3.19
MESP1-201ENST00000300057 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
MESP1-201ENST00000300057 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
MESP1-201ENST00000300057 ABCC8Q09428 1581 aa34.78■■■■□ 3.16
MESP1-201ENST00000300057 HRCP23327 699 aa34.69■■■■□ 3.14
MESP1-201ENST00000300057 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.55■■■■□ 3.12
MESP1-201ENST00000300057 HMGXB3Q12766 1538 aa34.45■■■■□ 3.11
MESP1-201ENST00000300057 NCAPD3P42695 1498 aa34.45■■■■□ 3.1
MESP1-201ENST00000300057 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.35■■■■□ 3.09
MESP1-201ENST00000300057 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.3■■■■□ 3.08
MESP1-201ENST00000300057 SOGA1O94964 1423 aa34.25■■■■□ 3.07
MESP1-201ENST00000300057 SYNJ1O43426 1573 aa34.22■■■■□ 3.07
MESP1-201ENST00000300057 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.12■■■■□ 3.05
MESP1-201ENST00000300057 EEA1Q15075 1411 aa34.08■■■■□ 3.05
MESP1-201ENST00000300057 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.04■■■■□ 3.04
MESP1-201ENST00000300057 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.99■■■■□ 3.03
MESP1-201ENST00000300057 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
MESP1-201ENST00000300057 CFTRP13569 1480 aa33.93■■■■□ 3.02
MESP1-201ENST00000300057 TOP2BQ02880 1626 aa33.92■■■■□ 3.02
MESP1-201ENST00000300057 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.85■■■■□ 3.01
MESP1-201ENST00000300057 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
MESP1-201ENST00000300057 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.77■■■■□ 3
MESP1-201ENST00000300057 GOLGA3Q08378 1498 aa33.77■■■■□ 3
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MESP1-201ENST00000300057 PRDM2Q13029 1718 aa33.74■■■□□ 2.99
MESP1-201ENST00000300057 CEP162Q5TB80 1403 aa33.74■■■□□ 2.99
MESP1-201ENST00000300057 CUX1P39880 1505 aa33.74■■■□□ 2.99
MESP1-201ENST00000300057 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.69■■■□□ 2.98
MESP1-201ENST00000300057 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.68■■■□□ 2.98
MESP1-201ENST00000300057 KIF21BO75037 1637 aa33.67■■■□□ 2.98
MESP1-201ENST00000300057 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
MESP1-201ENST00000300057 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.5■■■□□ 2.95
MESP1-201ENST00000300057 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.38■■■□□ 2.93
MESP1-201ENST00000300057 KIF27Q86VH2 1401 aa33.38■■■□□ 2.93
MESP1-201ENST00000300057 NESP48681 1621 aa33.34■■■□□ 2.93
MESP1-201ENST00000300057 CLIP1P30622 1438 aa33.31■■■□□ 2.92
MESP1-201ENST00000300057 PRXQ9BXM0 1461 aa33.31■■■□□ 2.92
MESP1-201ENST00000300057 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.28■■■□□ 2.92
MESP1-201ENST00000300057 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.27■■■□□ 2.92
MESP1-201ENST00000300057 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.24■■■□□ 2.91
MESP1-201ENST00000300057 CUX2O14529 1486 aa33.22■■■□□ 2.91
MESP1-201ENST00000300057 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.21■■■□□ 2.91
MESP1-201ENST00000300057 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.19■■■□□ 2.9
MESP1-201ENST00000300057 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.16■■■□□ 2.9
MESP1-201ENST00000300057 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.14■■■□□ 2.9
MESP1-201ENST00000300057 TOPBP1Q92547 1522 aa33.08■■■□□ 2.89
MESP1-201ENST00000300057 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.07■■■□□ 2.88
MESP1-201ENST00000300057 IGF1RP08069 1367 aa33.03■■■□□ 2.88
MESP1-201ENST00000300057 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.99■■■□□ 2.87
MESP1-201ENST00000300057 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.98■■■□□ 2.87
MESP1-201ENST00000300057 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
MESP1-201ENST00000300057 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.93■■■□□ 2.86
MESP1-201ENST00000300057 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.9■■■□□ 2.86
MESP1-201ENST00000300057 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.9■■■□□ 2.86
MESP1-201ENST00000300057 ARAP1Q96P48 1450 aa32.89■■■□□ 2.86
MESP1-201ENST00000300057 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.87■■■□□ 2.85
MESP1-201ENST00000300057 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.84■■■□□ 2.85
MESP1-201ENST00000300057 APLP2Q06481 763 aa32.84■■■□□ 2.85
MESP1-201ENST00000300057 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.74■■■□□ 2.83
MESP1-201ENST00000300057 WDR97A6NE52 1622 aa32.73■■■□□ 2.83
MESP1-201ENST00000300057 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
MESP1-201ENST00000300057 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.69■■■□□ 2.82
MESP1-201ENST00000300057 CUL7Q14999 1698 aa32.63■■■□□ 2.81
MESP1-201ENST00000300057 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
MESP1-201ENST00000300057 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
MESP1-201ENST00000300057 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.59■■■□□ 2.81
MESP1-201ENST00000300057 MYT1Q01538 1121 aa32.58■■■□□ 2.81
MESP1-201ENST00000300057 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.53■■■□□ 2.8
MESP1-201ENST00000300057 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
MESP1-201ENST00000300057 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.49■■■□□ 2.79
MESP1-201ENST00000300057 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
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