Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPPED1Q9BRF8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms