Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC39Q96DD0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC39Q96DD0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC39Q96DD0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms