Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRNIPQ6NTE8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRNIPQ6NTE8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRNIPQ6NTE8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRNIPQ6NTE8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms