Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB1Q16558 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNMB1Q16558 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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