Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RABEP1Q15276 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RABEP1Q15276 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RABEP1Q15276 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RABEP1Q15276 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RABEP1Q15276 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABEP1Q15276 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RABEP1Q15276 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABEP1Q15276 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RABEP1Q15276 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RABEP1Q15276 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RABEP1Q15276 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RABEP1Q15276 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
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RABEP1Q15276 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RABEP1Q15276 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RABEP1Q15276 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
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RABEP1Q15276 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RABEP1Q15276 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
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RABEP1Q15276 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RABEP1Q15276 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RABEP1Q15276 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
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RABEP1Q15276 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RABEP1Q15276 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RABEP1Q15276 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
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RABEP1Q15276 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
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RABEP1Q15276 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RABEP1Q15276 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RABEP1Q15276 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RABEP1Q15276 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RABEP1Q15276 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RABEP1Q15276 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RABEP1Q15276 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RABEP1Q15276 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
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