Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC4A3P48751 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC4A3P48751 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC4A3P48751 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SLC4A3P48751 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms