Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTFP26441 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTFP26441 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTFP26441 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTFP26441 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTFP26441 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTFP26441 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTFP26441 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTFP26441 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTFP26441 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTFP26441 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTFP26441 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTFP26441 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTFP26441 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTFP26441 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTFP26441 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTFP26441 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTFP26441 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTFP26441 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTFP26441 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTFP26441 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTFP26441 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTFP26441 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTFP26441 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTFP26441 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTFP26441 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTFP26441 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTFP26441 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTFP26441 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTFP26441 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTFP26441 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTFP26441 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTFP26441 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTFP26441 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTFP26441 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTFP26441 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTFP26441 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTFP26441 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTFP26441 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTFP26441 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTFP26441 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTFP26441 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTFP26441 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTFP26441 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTFP26441 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTFP26441 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTFP26441 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTFP26441 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTFP26441 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTFP26441 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTFP26441 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTFP26441 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTFP26441 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTFP26441 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTFP26441 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTFP26441 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTFP26441 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTFP26441 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTFP26441 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTFP26441 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTFP26441 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTFP26441 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTFP26441 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTFP26441 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTFP26441 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTFP26441 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTFP26441 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTFP26441 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTFP26441 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTFP26441 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTFP26441 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTFP26441 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTFP26441 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTFP26441 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTFP26441 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTFP26441 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTFP26441 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTFP26441 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTFP26441 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTFP26441 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTFP26441 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTFP26441 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTFP26441 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTFP26441 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTFP26441 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTFP26441 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTFP26441 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTFP26441 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTFP26441 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTFP26441 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTFP26441 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTFP26441 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTFP26441 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTFP26441 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTFP26441 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTFP26441 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTFP26441 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTFP26441 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTFP26441 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTFP26441 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms