Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLIN3O60664 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLIN3O60664 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLIN3O60664 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms