Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3B1O00203 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms