Protein–RNA interactions for Protein: A8MTJ6

FOXI3, Forkhead box protein I3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI3A8MTJ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXI3A8MTJ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXI3A8MTJ6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXI3A8MTJ6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms