Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCB6Q9NP58 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB6Q9NP58 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCB6Q9NP58 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB6Q9NP58 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB6Q9NP58 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB6Q9NP58 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB6Q9NP58 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB6Q9NP58 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB6Q9NP58 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCB6Q9NP58 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCB6Q9NP58 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCB6Q9NP58 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCB6Q9NP58 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCB6Q9NP58 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCB6Q9NP58 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCB6Q9NP58 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCB6Q9NP58 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCB6Q9NP58 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCB6Q9NP58 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCB6Q9NP58 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms