Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
REXO4Q9GZR2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
REXO4Q9GZR2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms