Protein–RNA interactions for Protein: Q86U02

LINC00596, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00596, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00596Q86U02 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00596Q86U02 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00596Q86U02 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms