Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP2LQ5T4T6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2LQ5T4T6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms