Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 CNOT7-212ENST00000524358 700 ntTSL 39.47□□□□□ -0.892e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 SGK494-208ENST00000527918 632 ntTSL 29.45□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MCM8-203ENST00000378886 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TDP1-202ENST00000393452 2370 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.912e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NAPA-213ENST00000597118 553 ntTSL 49.32□□□□□ -0.922e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MCM8-202ENST00000378883 3574 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.932e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PPP1R13B-215ENST00000557082 4254 ntTSL 59.23□□□□□ -0.932e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TDP1-204ENST00000545686 2488 ntTSL 1 (best)9.17□□□□□ -0.942e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TDP1-210ENST00000554976 3040 ntTSL 29.15□□□□□ -0.942e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MLST8-228ENST00000567623 855 ntTSL 39.12□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NPC2-203ENST00000541064 1436 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.962e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.962e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PPFIA1-206ENST00000526262 4537 ntTSL 1 (best)8.94□□□□□ -0.982e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TDP1-203ENST00000393454 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -12e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NAPA-208ENST00000594288 562 ntTSL 48.55□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MARK4-204ENST00000588533 625 ntTSL 28.54□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NPC2-201ENST00000238633 796 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.052e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NPC2-209ENST00000557510 1029 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.062e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MYL5-205ENST00000505477 584 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.092e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.112e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NDUFS8-209ENST00000526542 372 ntTSL 38.05□□□□□ -1.122e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.132e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NSUN2-205ENST00000505892 3558 ntTSL 1 (best)7.85□□□□□ -1.152e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NPC2-204ENST00000553490 729 ntTSL 27.77□□□□□ -1.172e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 IQSEC1-203ENST00000474467 436 ntTSL 37.7□□□□□ -1.182e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.182e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TDP1-214ENST00000556063 1076 ntTSL 1 (best)7.47□□□□□ -1.212e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NAPA-220ENST00000601927 429 ntTSL 37.38□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.242e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 KIAA0319L-212ENST00000473844 513 ntTSL 36.77□□□□□ -1.332e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TTLL4-208ENST00000436668 738 ntTSL 56.59□□□□□ -1.352e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ZC3H15-209ENST00000498757 881 ntTSL 26.3□□□□□ -1.42e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.432e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 KIAA0319L-213ENST00000474856 295 ntTSL 36.08□□□□□ -1.442e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 AP002807.1-201ENST00000529934 326 ntTSL 56.06□□□□□ -1.442e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.452e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TTLL4-216ENST00000472527 544 ntTSL 24.64□□□□□ -1.672e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.72e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PRPF38A-203ENST00000487160 926 ntTSL 24.31□□□□□ -1.722e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ZC3H15-204ENST00000445547 776 ntTSL 23.67□□□□□ -1.822e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.862e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NSUN2-209ENST00000514127 614 ntTSL 33.28□□□□□ -1.882e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.972e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TTLL4-205ENST00000417855 601 ntTSL 32.03□□□□□ -2.082e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 CNOT9-207ENST00000489687 288 ntTSL 35.53□□□□□ -1.527e-7■■■■■ 57.5
EFTUD2Q15029 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.538e-8■■■■■ 57.5
EFTUD2Q15029 LRRC47-202ENST00000462356 575 ntTSL 212.82□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 57.5
EFTUD2Q15029 LRRC47-203ENST00000479239 434 ntTSL 36.2□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 57.5
EFTUD2Q15029 MAP2K7-205ENST00000468058 1589 ntTSL 226.91■■□□□ 1.92e-7■■■■■ 57.5
EFTUD2Q15029 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 57.5
EFTUD2Q15029 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 57.5
EFTUD2Q15029 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-7■■■■■ 57.5
EFTUD2Q15029 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.215e-9■■■■■ 57.5
EFTUD2Q15029 VAMP7-201ENST00000262640 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.35e-9■■■■■ 57.5
EFTUD2Q15029 VAMP7-206ENST00000488344 696 ntTSL 210.5□□□□□ -0.735e-9■■■■■ 57.5
EFTUD2Q15029 VAMP7-203ENST00000460621 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.85e-9■■■■■ 57.5
EFTUD2Q15029 VAMP7-205ENST00000479687 742 ntTSL 56.46□□□□□ -1.385e-9■■■■■ 57.5
EFTUD2Q15029 VAMP7-204ENST00000463317 673 ntTSL 54.92□□□□□ -1.625e-9■■■■■ 57.5
EFTUD2Q15029 SLC3A2-205ENST00000457660 873 ntTSL 512.09□□□□□ -0.471e-12■■■■■ 57.4
EFTUD2Q15029 SNHG1-201ENST00000535076 849 ntTSL 25.34□□□□□ -1.553e-24■■■■■ 57.3
EFTUD2Q15029 CCDC102B-211ENST00000584775 1179 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.653e-10■■■■■ 57.3
EFTUD2Q15029 CCDC102B-202ENST00000577772 1537 ntTSL 26.93□□□□□ -1.33e-10■■■■■ 57.3
EFTUD2Q15029 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.353e-10■■■■■ 57.3
EFTUD2Q15029 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.763e-10■■■■■ 57.3
EFTUD2Q15029 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.953e-10■■■■■ 57.3
EFTUD2Q15029 CCDC102B-203ENST00000577800 589 ntTSL 32.8□□□□□ -1.963e-10■■■■■ 57.3
EFTUD2Q15029 CCDC102B-206ENST00000581103 324 ntTSL 51.77□□□□□ -2.133e-10■■■■■ 57.3
EFTUD2Q15029 RPL8-212ENST00000532702 745 ntTSL 214.77□□□□□ -0.055e-12■■■■■ 57.3
EFTUD2Q15029 GMDS-201ENST00000380805 1743 ntTSL 219.84■□□□□ 0.772e-13■■■■■ 57.2
EFTUD2Q15029 GMDS-203ENST00000467288 900 ntTSL 518.37■□□□□ 0.532e-13■■■■■ 57.2
EFTUD2Q15029 GMDS-204ENST00000476972 591 ntTSL 218.09■□□□□ 0.492e-13■■■■■ 57.2
EFTUD2Q15029 GMDS-205ENST00000486793 567 ntTSL 317.38■□□□□ 0.372e-13■■■■■ 57.2
EFTUD2Q15029 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.93e-7■■■■■ 57.2
EFTUD2Q15029 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.263e-7■■■■■ 57.2
EFTUD2Q15029 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.913e-7■■■■■ 57.2
EFTUD2Q15029 TNFRSF1A-209ENST00000536717 1503 ntTSL 217.13■□□□□ 0.338e-7■■■■■ 57.2
EFTUD2Q15029 ATP5B-209ENST00000551570 399 ntTSL 38.25□□□□□ -1.093e-35■■■■■ 56.9
EFTUD2Q15029 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.426e-7■■■■■ 56.7
EFTUD2Q15029 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.464e-8■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.244e-8■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 ACP2-210ENST00000531004 1457 ntTSL 215.26■□□□□ 0.034e-8■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 ACP2-207ENST00000529663 967 ntTSL 1 (best)15.17■□□□□ 0.024e-8■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 ACP2-213ENST00000534448 2170 ntTSL 514.95□□□□□ -0.024e-8■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.144e-8■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.174e-8■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 ACP2-211ENST00000531547 980 ntTSL 213.74□□□□□ -0.214e-8■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 YIPF2-211ENST00000592505 530 ntTSL 315.49■□□□□ 0.075e-8■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 RPS2-206ENST00000527302 719 ntTSL 324.7■■□□□ 1.543e-15■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 RPS2-207ENST00000527826 837 ntTSL 1 (best)23.7■■□□□ 1.383e-15■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 RPL8-209ENST00000529920 876 ntTSL 216.46■□□□□ 0.233e-13■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 RPL8-206ENST00000528296 540 ntTSL 316.29■□□□□ 0.23e-13■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 RPL8-204ENST00000526668 717 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.073e-13■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 RPL8-211ENST00000531975 698 ntTSL 311.37□□□□□ -0.593e-13■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 NXF1-217ENST00000533671 589 ntTSL 416.8■□□□□ 0.282e-8■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-238ENST00000521116 806 ntTSL 420.92■□□□□ 0.948e-38■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-245ENST00000523137 1563 ntTSL 419.03■□□□□ 0.648e-38■■■■■ 56.6
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