Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.628e-76■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 SNHG12-201ENST00000461448 1629 ntTSL 1 (best)21.36■■□□□ 1.018e-76■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 SNHG12-206ENST00000474814 1903 ntTSL 220.63■□□□□ 0.898e-76■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 SNHG12-208ENST00000481220 751 ntTSL 319.91■□□□□ 0.788e-76■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.198e-76■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 SNHG12-209ENST00000481368 1588 ntTSL 1 (best)15.79■□□□□ 0.128e-76■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 SNHG12-205ENST00000470977 1098 ntTSL 1 (best)13.97□□□□□ -0.178e-76■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 SNHG12-211ENST00000488745 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.548e-76■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 SNHG12-204ENST00000464612 719 ntTSL 1 (best)9.82□□□□□ -0.848e-76■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.238e-76■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.47■□□□□ 0.878e-68■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.75■□□□□ 0.598e-68■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.54e-12■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC6.81□□□□□ -1.321e-7■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.037e-11■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.77e-11■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.017e-11■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 HSPA8-222ENST00000534319 1884 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.27e-11■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 HSPA8-201ENST00000227378 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.237e-11■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 HSPA8-215ENST00000532091 2301 ntTSL 513.52□□□□□ -0.257e-11■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 HSPA8-203ENST00000524552 963 ntTSL 1 (best)13.32□□□□□ -0.287e-11■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 HSPA8-218ENST00000532636 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.327e-11■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 HSPA8-207ENST00000526110 1924 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.327e-11■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 SERPINA5-202ENST00000553511 574 ntTSL 214.74□□□□□ -0.059e-16■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 SERPINA5-209ENST00000555681 618 ntTSL 214.68□□□□□ -0.069e-16■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 SERPINA5-211ENST00000556730 1463 ntTSL 211.94□□□□□ -0.59e-16■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 SERPINA5-206ENST00000554633 533 ntTSL 411.56□□□□□ -0.569e-16■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 SERPINA5-207ENST00000554760 1113 ntTSL 211.09□□□□□ -0.639e-16■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 SERPINA5-204ENST00000554220 586 ntTSL 411.09□□□□□ -0.639e-16■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 SERPINA5-212ENST00000556775 829 ntTSL 511.09□□□□□ -0.639e-16■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 SPTB-206ENST00000553938 3456 ntTSL 1 (best)14.43□□□□□ -0.12e-7■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.242e-7■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 SPTB-208ENST00000556626 10153 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.412e-7■■■■□ 25.5
NOLC1Q14978 TMEM107-205ENST00000449985 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.111e-323■■■■□ 25.3
NOLC1Q14978 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.78□□□□□ -2.281e-323■■■■□ 25.3
NOLC1Q14978 COPB1-208ENST00000532088 510 ntTSL 313.66□□□□□ -0.226e-13■■■■□ 25.3
NOLC1Q14978 COPB1-201ENST00000249923 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.496e-13■■■■□ 25.3
NOLC1Q14978 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.666e-13■■■■□ 25.3
NOLC1Q14978 COPB1-203ENST00000525214 566 ntTSL 27.77□□□□□ -1.176e-13■■■■□ 25.3
NOLC1Q14978 IGSF1-207ENST00000467244 849 ntTSL 212.72□□□□□ -0.375e-6■■■■□ 25.2
NOLC1Q14978 MRPS23-201ENST00000313608 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.812e-7■■■■□ 25.1
NOLC1Q14978 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.669e-10■■■■□ 25.1
NOLC1Q14978 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.119e-10■■■■□ 25.1
NOLC1Q14978 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.149e-10■■■■□ 25.1
NOLC1Q14978 PSMA1-207ENST00000528307 1394 ntTSL 56.76□□□□□ -1.339e-10■■■■□ 25.1
NOLC1Q14978 PSMA1-203ENST00000524606 646 ntTSL 26.24□□□□□ -1.419e-10■■■■□ 25.1
NOLC1Q14978 HLA-C-208ENST00000487245 1880 nt30.64■■■□□ 2.51e-6■■■■□ 25
NOLC1Q14978 HLA-C-202ENST00000376237 1538 nt25.02■■□□□ 1.61e-6■■■■□ 25
NOLC1Q14978 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.311e-6■■■■□ 25
NOLC1Q14978 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.31e-6■■■■□ 25
NOLC1Q14978 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.498e-8■■■■□ 25
NOLC1Q14978 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.348e-8■■■■□ 25
NOLC1Q14978 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.128e-8■■■■□ 25
NOLC1Q14978 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.128e-8■■■■□ 25
NOLC1Q14978 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.347e-18■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 EMC1-206ENST00000475079 557 ntTSL 411.46□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 EMC1-211ENST00000488681 562 ntTSL 311□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 HSPA8-208ENST00000526686 740 ntTSL 1 (best)4.3□□□□□ -1.721e-323■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.991e-323■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.361e-323■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.331e-323■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-323■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 EEF1B2-205ENST00000429769 912 ntTSL 511.92□□□□□ -0.51e-323■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 EEF1B2-208ENST00000455150 670 ntTSL 56.55□□□□□ -1.361e-323■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.117e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 27e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 ZNF692-203ENST00000412341 1916 ntTSL 525.85■■□□□ 1.737e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.527e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.277e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 ZNF692-211ENST00000477070 1521 ntTSL 522.82■■□□□ 1.247e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.217e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 ZNF692-227ENST00000533927 2026 ntTSL 1 (best)20.51■□□□□ 0.877e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.787e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 ZNF692-210ENST00000476503 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.18■□□□□ 0.667e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.587e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 ZNF692-206ENST00000463519 2704 ntTSL 1 (best)18.11■□□□□ 0.497e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.377e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 RPRD1A-208ENST00000589050 1022 ntTSL 1 (best)16.92■□□□□ 0.37e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 ZNF692-213ENST00000482023 851 ntTSL 512.4□□□□□ -0.427e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 CRNDE-202ENST00000502066 659 ntTSL 1 (best)7.51□□□□□ -1.217e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.37e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 CRNDE-208ENST00000560029 659 ntTSL 26.71□□□□□ -1.347e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.367e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 CRNDE-207ENST00000559598 696 ntTSL 1 (best)6.53□□□□□ -1.367e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 CRNDE-204ENST00000558031 464 ntTSL 25.27□□□□□ -1.577e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 RPRD1A-204ENST00000585953 2357 ntTSL 33.42□□□□□ -1.867e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 RPRD1A-210ENST00000591994 2484 ntTSL 23.34□□□□□ -1.877e-8■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 H2AFZ-202ENST00000511203 1880 ntTSL 232.54■■■□□ 2.83e-11■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 H2AFZ-203ENST00000511319 1254 ntTSL 1 (best)31.79■■■□□ 2.683e-11■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.483e-11■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 H2AFZ-204ENST00000511348 1843 ntTSL 1 (best)15.71■□□□□ 0.113e-11■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 H2AFZ-206ENST00000529158 726 ntTSL 310.92□□□□□ -0.663e-11■■■■□ 24.9
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-228ENST00000584141 564 ntTSL 220.02■□□□□ 0.86e-28■■■■□ 24.8
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-219ENST00000578757 920 ntTSL 1 (best)14.08□□□□□ -0.166e-28■■■■□ 24.8
NOLC1Q14978 EIF4A2-217ENST00000475409 802 ntTSL 25.82□□□□□ -1.481e-323■■■■□ 24.7
NOLC1Q14978 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.832e-12■■■■□ 24.7
NOLC1Q14978 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.782e-12■■■■□ 24.7
NOLC1Q14978 LUC7L3-204ENST00000503798 663 ntTSL 37.35□□□□□ -1.237e-10■■■■□ 24.7
NOLC1Q14978 TAF1D-207ENST00000527169 1127 ntTSL 519.24■□□□□ 0.672e-82■■■■□ 24.7
NOLC1Q14978 TAF1D-214ENST00000530089 1429 ntTSL 37.07□□□□□ -1.282e-82■■■■□ 24.7
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