Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 TRRAP-203ENST00000417523 550 ntTSL 417.95■□□□□ 0.464e-133■■■■■ 616.9
NOLC1Q14978 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.14e-133■■■■■ 616.9
NOLC1Q14978 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.134e-133■■■■■ 616.9
NOLC1Q14978 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.144e-133■■■■■ 616.9
NOLC1Q14978 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.324e-133■■■■■ 616.9
NOLC1Q14978 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.6□□□□□ -1.991e-323■■■■■ 610.9
NOLC1Q14978 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC8.26□□□□□ -1.095e-291■■■■■ 608.2
NOLC1Q14978 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.45e-291■■■■■ 608.2
NOLC1Q14978 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.595e-291■■■■■ 608.2
NOLC1Q14978 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 43.87□□□□□ -1.795e-291■■■■■ 608.2
NOLC1Q14978 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.56□□□□□ -1.845e-132■■■■■ 383.5
NOLC1Q14978 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.79□□□□□ -2.125e-170■■■■■ 310.9
NOLC1Q14978 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.113e-10■■■■■ 289.9
NOLC1Q14978 THAP9-AS1-207ENST00000507660 550 ntTSL 311.17□□□□□ -0.628e-139■■■■■ 280.8
NOLC1Q14978 THAP9-AS1-212ENST00000513581 683 ntTSL 210.85□□□□□ -0.678e-139■■■■■ 280.8
NOLC1Q14978 THAP9-AS1-206ENST00000505028 552 ntTSL 47.58□□□□□ -1.28e-139■■■■■ 280.8
NOLC1Q14978 THAP9-AS1-203ENST00000504718 573 ntTSL 47.25□□□□□ -1.258e-139■■■■■ 280.8
NOLC1Q14978 RPL23A-209ENST00000582736 595 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.131e-323■■■■■ 269.4
NOLC1Q14978 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.79□□□□□ -2.281e-323■■■■■ 269.4
NOLC1Q14978 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.28□□□□□ -2.043e-42■■■■■ 220.2
NOLC1Q14978 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 410.85□□□□□ -0.672e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 410.85□□□□□ -0.672e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.772e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 410.17□□□□□ -0.782e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 29.38□□□□□ -0.912e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 THAP9-AS1-211ENST00000512932 971 ntTSL 29.16□□□□□ -0.942e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 48.18□□□□□ -1.12e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 47.76□□□□□ -1.172e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.362e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 RPL37-202ENST00000504562 505 ntTSL 212.41□□□□□ -0.421e-323■■■■■ 207.7
NOLC1Q14978 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.021e-323■■■■■ 207.7
NOLC1Q14978 RPL37-203ENST00000507642 425 ntTSL 38.5□□□□□ -1.051e-323■■■■■ 207.7
NOLC1Q14978 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.171e-323■■■■■ 207.7
NOLC1Q14978 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.38□□□□□ -2.031e-323■■■■■ 207.7
NOLC1Q14978 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.273e-34■■■■■ 207.4
NOLC1Q14978 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.613e-34■■■■■ 207.4
NOLC1Q14978 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.521e-323■■■■■ 201.4
NOLC1Q14978 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.135e-125■■■■■ 194
NOLC1Q14978 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.125e-125■■■■■ 194
NOLC1Q14978 RC3H2-210ENST00000498479 5746 ntTSL 214.13□□□□□ -0.155e-125■■■■■ 194
NOLC1Q14978 RC3H2-202ENST00000357244 3991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.365e-125■■■■■ 194
NOLC1Q14978 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.655e-125■■■■■ 194
NOLC1Q14978 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.235e-125■■■■■ 194
NOLC1Q14978 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.79□□□□□ -1.963e-67■■■■■ 184.6
NOLC1Q14978 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.14□□□□□ -2.231e-13■■■■■ 183
NOLC1Q14978 SNHG16-208ENST00000591956 556 ntTSL 212.44□□□□□ -0.423e-75■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.443e-75■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 SNHG16-204ENST00000586942 568 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.623e-75■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 SNHG16-207ENST00000590435 1947 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.723e-75■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 SNHG16-202ENST00000493536 2424 ntTSL 1 (best)9.69□□□□□ -0.863e-75■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 SNHG16-206ENST00000587838 884 ntTSL 36.17□□□□□ -1.423e-75■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.741e-259■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 NCAPD2-202ENST00000382457 2844 ntTSL 512.93□□□□□ -0.341e-259■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 NCAPD2-207ENST00000539084 4290 ntTSL 211.79□□□□□ -0.521e-259■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 NCAPD2-208ENST00000539714 533 ntTSL 37.53□□□□□ -1.21e-259■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 NCAPD2-210ENST00000541399 584 ntTSL 57.35□□□□□ -1.231e-259■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.17□□□□□ -1.581e-259■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.421e-22■■■■■ 152.3
NOLC1Q14978 NOP58-208ENST00000488403 871 ntTSL 216.07■□□□□ 0.161e-323■■■■■ 149.9
NOLC1Q14978 NOP58-202ENST00000426814 655 ntTSL 215.79■□□□□ 0.121e-323■■■■■ 149.9
NOLC1Q14978 NOP58-204ENST00000467734 638 ntTSL 512.35□□□□□ -0.431e-323■■■■■ 149.9
NOLC1Q14978 NOP58-205ENST00000472050 582 ntTSL 312.3□□□□□ -0.441e-323■■■■■ 149.9
NOLC1Q14978 NOP58-209ENST00000492688 571 ntTSL 45.83□□□□□ -1.481e-323■■■■■ 149.9
NOLC1Q14978 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.34□□□□□ -2.191e-53■■■■■ 144.6
NOLC1Q14978 RPL23A-205ENST00000472628 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.476e-40■■■■■ 143.2
NOLC1Q14978 HSPA9-207ENST00000507097 1796 ntTSL 216.24■□□□□ 0.192e-54■■■■■ 142.4
NOLC1Q14978 HSPA9-212ENST00000523929 780 ntTSL 415.45■□□□□ 0.062e-54■■■■■ 142.4
NOLC1Q14978 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.512e-54■■■■■ 142.4
NOLC1Q14978 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 33.69□□□□□ -1.822e-54■■■■■ 142.4
NOLC1Q14978 HSPA9-210ENST00000508003 582 ntTSL 212.31□□□□□ -0.441e-323■■■■■ 142
NOLC1Q14978 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.49□□□□□ -1.851e-323■■■■■ 142
NOLC1Q14978 UBAP2-206ENST00000412543 1349 ntTSL 57.62□□□□□ -1.196e-153■■■■■ 142
NOLC1Q14978 UBAP2-207ENST00000421278 833 ntTSL 56.44□□□□□ -1.386e-153■■■■■ 142
NOLC1Q14978 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.131e-323■■■■■ 138.7
NOLC1Q14978 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.021e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.951e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-203ENST00000519369 824 ntTSL 214.67□□□□□ -0.061e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-208ENST00000521262 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.21e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-209ENST00000521289 737 ntTSL 511.99□□□□□ -0.491e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-212ENST00000618656 627 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.751e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-207ENST00000520627 423 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.771e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-201ENST00000009589 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.911e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-204ENST00000519606 424 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.911e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-206ENST00000520490 402 ntTSL 38.86□□□□□ -0.991e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.081e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.151e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.631e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.216e-40■■■■■ 136.2
NOLC1Q14978 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.026e-40■■■■■ 136.2
NOLC1Q14978 RPL23A-202ENST00000394935 580 ntTSL 310.73□□□□□ -0.696e-40■■■■■ 136.2
NOLC1Q14978 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.056e-40■■■■■ 136.2
NOLC1Q14978 RPL23A-201ENST00000355731 587 ntTSL 57.26□□□□□ -1.256e-40■■■■■ 136.2
NOLC1Q14978 RPL7A-208ENST00000492798 374 ntTSL 1 (best)6.79□□□□□ -1.321e-323■■■■■ 135.2
NOLC1Q14978 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC5.33□□□□□ -1.561e-260■■■■■ 134.4
NOLC1Q14978 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.18□□□□□ -2.061e-323■■■■■ 132.1
NOLC1Q14978 RPL23A-208ENST00000580755 412 ntTSL 217.41■□□□□ 0.387e-261■■■■■ 127.7
NOLC1Q14978 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.941e-323■■■■■ 127
NOLC1Q14978 CCAR1-207ENST00000536012 2447 ntTSL 1 (best)8.91□□□□□ -0.981e-323■■■■■ 127
NOLC1Q14978 CCAR1-214ENST00000543225 2407 ntTSL 1 (best)8.26□□□□□ -1.091e-323■■■■■ 127
Retrieved 100 of 7,921 protein–RNA pairs in 28.9 ms